Rieky formujú krajinu Bosny a Hercegoviny, rozdeľujú územie medzi povodia Čierneho mora cez Savu a povodie Jadranského mora. V krajine sa nachádzajú veľké toky, mnoho prítokov a špecifické krasové javy, ktoré ovplyvňujú režim vôd.

Hlavné rieky
- Sava — tvorí severnú hranicu a prijíma množstvo riek z Bosny; patrí do povodia Dunaja.
- Bosna — centrálne orientovaný tok, ktorý tečie na sever a ústi do Savy.
- Neretva — najväčšia rieka Hercegoviny, tečie južným smerom k Jadranu.
- Drina — vzniká ztokom Tary a Pivy a čiastočne tvorí hranicu so Srbskom; významný hraničný a morsko-hydrografický prvok.
- Una — severozápadný tok známy priehradami, vodopádmi a bohatou prírodou; prítok Savy.
- Vrbas — dôležitý tok strednej Bosny, prispievajúci do povodia Savy.
- Sana — významný prítok Úny v severozápadnej Bosne, s čistými horskými úsekmi.
- Trebišnjica — karstová rieka Hercegoviny, známa ponormi a ovplyvnením zásahmi do krajinnej hydrológie.
Povodzia a charakter toku
Územie patrí do dvoch hlavných hydrologických celkov: väčšina tokov odteká cez Savu do Dunaja a ďalej do Čierneho mora, zatiaľ čo južné rieky, najmä Neretva, odtekajú do Jadranského mora. Mnohé toky majú horský typ s rýchlym tokom, kaňonmi a vodopádmi; v krasových oblastiach sa vyskytujú ponory a podzemné riečne úseky.
Ekologické a hospodárske aspekty
Rieky sú významné pre zásobovanie vodou, energetiku (vodné elektrárne), poľnohospodárstvo a rekreáciu. Súčasné výzvy zahŕňajú reguláciu vodných režimov, znečistenie a potrebu ochrany biotopov a kvality vôd. Niektoré úseky sú súčasťou chránených oblastí a národných parkov.
Ďalšie poznámky
- Okrem menovaných hlavných tokov existuje mnoho menších riek a potokov, ktoré významne vplývajú na miestne ekosystémy.
- Štruktúra povodia a dynamika prietoku sú ovplyvnené reliéfom, podnebím a ľudskou činnosťou.