Roemer bol jedným z veľkého počtu demokratických kandidátov, ktorí chceli vyzvať trojnásobného guvernéra Edwina Edwardsa. Roemer vyhral voľby, keď získal 33 % hlasov v porovnaní s Edwardsovými 28 %.
Roemer nastúpil do úradu guvernéra 14. marca 1988. V októbri 1989 voliči odmietli niekoľko Roemerových daňových iniciatív, ale schválili ústavný dodatok na zlepšenie dopravy. Tvárou v tvár deficitu štátneho rozpočtu vo výške 1,3 miliardy dolárov bolo jeho prvou úlohou odstránenie deficitu. Roemer zvolal mimoriadne zasadnutie zákonodarného zboru, aby presadil ambiciózny program daňovej a fiškálnej reformy štátnej správy a samosprávy. Prisľúbil, že zníži výdavky, zruší programy a zatvorí štátom riadené inštitúcie. Voliči jeho návrhy odmietli v celoštátnom ústavnom referende.
V marci 1991 Roemer prešiel do Republikánskej strany len niekoľko mesiacov pred štátnymi voľbami, zrejme na naliehanie šéfa kancelárie Bushovho Bieleho domu Johna H. Sununu. Roemer prehral svoje znovuzvolenie po tom, ako prehral republikánske primárky s Davidom Dukom. Duke čoskoro prehral s Edwinom Edwardsom.
Roemer opustil svoj úrad 13. januára 1992. Opäť sa uchádzal o republikánsku nomináciu na guvernéra, ale prehral s Mikom Fosterom.