Loď vyplávala z argentínskej Ushuaie 11. novembra 2007 na 19-dňovú plavbu, ktorej cieľom bolo sledovať trasu objaviteľa 20. storočia Ernesta Shackletona cez Drakeov prieliv (oblasť, pre ktorú je typické rozbúrené more). Po návšteve Falklandských ostrovov a ostrova Južná Georgia narazil Explorer 23. novembra 2007 na neidentifikovaný ponorený objekt v Bransfieldovom prielive neďaleko ostrova Kráľa Juraja v Antarktíde, v blízkosti Južných Shetlandských ostrovov. Objekt, do ktorého Explorer narazil, spôsobil na ľavom boku lode (ľavá strana) dieru s rozmermi 10 × 4 palce (25 × 10 cm), ktorou sa do lode dostala morská voda.
Približne o 03:00 UTC nahlásil jeden z cestujúcich výskyt morskej vody v kabíne. Hoci niektoré správy uvádzajú, že nedošlo k žiadnemu výraznému nárazu alebo aspoň k ničomu väčšiemu ako k bežnému vŕzganiu ľadu, ktoré sa vyskytuje pri plavbe v ľadových vodách, iné správy hovoria o hlasnom buchnutí. Niektoré správy tiež uvádzajú, že loď narazila do ľadovca na pravoboku Explorera, zatiaľ čo posádka posudzovala škody spôsobené pôvodným nárazom do ľavoboku lode.
Loď o 04:24 UTC vyhlásila poplach a záchranné operácie rýchlo koordinovala námorná prefektúra (pobrežná stráž) Argentínskej republiky a centrum čílskeho námorníctva pre pátranie a záchranu. Čile vyslalo ľadoborec Almirante Viel a neďaleké komerčné lode vrátane MN Ushuaia, National Geographic Endeavor a nórskej pobrežnej expresnej lode MS Nordnorge, ktorá v tom čase fungovala ako osobná výletná loď. Do 7:30 UTC opustilo loď všetkých 91 cestujúcich, 9 sprievodcov a 54 členov posádky z viac ako 14 krajín a nasadli na záchranné člny, na ktorých driftovali tri až štyri hodiny, kým ich nevyzdvihla nórska loď MS Nordnorge, ktorá dorazila na miesto o 10:00 UTC. Predpokladá sa, že Explorer sa potopil približne o 19:00 UTC. Zhodou okolností sa predtým v roku 2007 loď MS Nordnorge zúčastnila na inej antarktickej záchrannej akcii, keď evakuovala 294 cestujúcich zo sesterskej lode MS Nordkapp, keď Nordkapp uviazla na plytčine na ostrove Deception, ktorý je súčasťou toho istého odľahlého súostrovia Južné Shetlandy.
Niektorí z tých, ktorých zachránila loď Nordnorge, boli prevezení na čilskú stanicu Eduardo Frei Montalva na ostrove King George. Neskôr ich dopravilo dopravné lietadlo C-130 Hercules čílskych vzdušných síl do Punta Arenas v Čile v dvoch samostatných letoch v sobotu 24. novembra a v nedeľu 25. novembra 2007. Približne 70 preživších bolo prevezených na základňu Artigas v Uruguaji. Explorer sa potopil v priebehu 20 hodín po náraze do neznámeho ponoreného objektu, ktorý bol údajne ľad.
