V roku 1920 sa v texaskom Houstone stretli športoví funkcionári šiestich texaských vysokých škôl - C. H. Fuller z Bishop College, Red Randolph a C. H. Patterson z Paul Quinn College, E. G. Evans, H. J. Evans a H. J. Starns z Prairie View A&M, D. C. Fuller z Texas College a G. Whitte Jordan z Wiley College - aby prediskutovali spoločné záujmy. Na tomto stretnutí sa dohodli na vytvorení novej ligy SWAC.
Paul Quinn sa stal prvým z pôvodných členov, ktorý opustil ligu v roku 1929. Keď o dva roky neskôr do konferencie vstúpila Langstonova univerzita v Oklahome, začala sa migrácia štátom podporovaných inštitúcií do SWAC. Southern University vstúpila do ligy v roku 1934. Arkansas AM&N vstúpila v roku 1936 a Texas Southern University v roku 1954.
Keďže štátom podporované školy sa rozrástli, pre cirkevné školy bolo ťažké platiť športové tímy. Čoskoro začali cirkvou podporované školy opúšťať konferenciu. Bishop vystúpil z konferencie v roku 1956, Langston v roku 1957 a Huston-Tillotson (predtým Samuel Huston) v roku 1959. Stalo sa tak rok po tom, čo do ligy vstúpili ďalšie dve štátom podporované školy (Grambling College a Jackson State College). Cyklus vstupov a odchodov pokračoval v roku 1961, keď z ligy vystúpila Texas College, po ktorej nasledoval vstup Alcorn A&M v roku 1962. Wiley odišla v roku 1968, v tom istom roku, keď vstúpila Mississippi Valley State College. Arkansas AM&N vystúpila v roku 1970 a Alabama State University vstúpila v roku 1982. Arkansas-Pine Bluff (predtým Arkansas AM&N) sa vrátila do SWAC 1. júla 1997 a o rok neskôr získala štatút riadneho člena. Univerzita Alabama A&M sa stala desiatym členom konferencie, keď sa v septembri 1999 stala riadnym členom po ročnom období ako pridružený člen SWAC.
Súčasné majstrovstvá SWAC zahŕňajú súťaže mužov v bejzbale, basketbale, cezpoľnom behu, futbale, golfe, halovej atletike, atletike a tenise. Ženská súťaž sa ponúka v športoch basketbal, bowling, cross country, golf, halová atletika, vonkajšia atletika, futbal, softbal, tenis a volejbal.
