V roku 2006 sa Fire a Craig Mello podelili o Nobelovu cenu za fyziológiu alebo medicínu za prácu prvýkrát publikovanú v roku 1998 v časopise Nature. V práci sa uvádza, že malé úseky dvojvláknovej RNA (dsRNA) účinne vypínali špecifické gény, a tak spôsobovali deštrukciu messengerovej RNA (mRNA) so sekvenciami zhodnými s dsRNA. V dôsledku toho sa mRNA nemôže preložiť na bielkovinu.
Fire a Mello zistili, že dsRNA je oveľa účinnejšia pri umlčovaní génov ako predtým opísaná metóda RNA interferencie s jednoreťazcovou RNA. Keďže na pozorovaný účinok bol potrebný len malý počet molekúl dsRNA, Fire a Mello navrhli, že ide o katalytický proces. Túto hypotézu potvrdil neskorší výskum.
V oznámení o udelení Nobelovej ceny, ktoré vydal švédsky Karolinský inštitút, sa uvádza: "Tohtoroční laureáti Nobelovej ceny objavili základný mechanizmus kontroly toku genetickej informácie". Britská rozhlasová a televízna spoločnosť (BBC) citovala Nicka Hastieho, riaditeľa oddelenia pre ľudskú genetiku Rady pre lekársky výskum, ktorý sa vyjadril k rozsahu a dôsledkom výskumu:
"Je veľmi nezvyčajné, aby jedna práca úplne zmenila spôsob, akým uvažujeme o biologických procesoch a regulácii, ale táto práca otvorila úplne novú oblasť v biológii."