Ribonukleová kyselina

RNA je skratka pre ribonukleovú kyselinu, nukleovú kyselinu. V súčasnosti je známych mnoho rôznych druhov.

RNA sa fyzikálne líši od DNA: DNA obsahuje dve navzájom stočené vlákna, ale RNA obsahuje len jedno vlákno. RNA obsahuje aj iné bázy ako DNA. Tieto bázy sú nasledovné:

(A) Adenín

(G) Guanín

(U) Uracil

Adenín vytvára väzby s uracilom a guanín s cytozínom. Týmto spôsobom hovoríme, že adenín je komplementárny k uracilu a guanín je komplementárny k cytozínu. Prvé tri bázy sa nachádzajú aj v DNA, ale uracil nahrádza tymín ako komplement k adenínu.

RNA tiež obsahuje ribózu na rozdiel od deoxyribózy, ktorá sa nachádza v DNA. Tieto rozdiely spôsobujú, že RNA je chemicky reaktívnejšia ako DNA. To z nej robí vhodnejšiu molekulu na účasť v bunkových reakciách.

RNA je nositeľom genetickej informácie v niektorých vírusoch, najmä v retrovírusoch, ako je vírus HIV. Toto je jediná výnimka zo všeobecného pravidla, že DNA je dedičná látka.

Syntéza bielkovín RNA

Messenger RNA

Hlavnou funkciou RNA je prenášať informácie o aminokyselinovej sekvencii z génov do miesta, kde sa na ribozómoch v cytoplazme zostavujú proteíny.

To sa uskutočňuje prostredníctvom messengerovej RNA (mRNA). Jedno vlákno DNA je predlohou pre mRNA, ktorá sa z tohto vlákna DNA prepisuje. Sekvenciu párov báz prepisuje z DNA enzým nazývaný RNA polymeráza. Potom sa mRNA presunie z jadra do ribozómov v cytoplazme, kde sa z nej vytvoria bielkoviny. MRNA prekladá sekvenciu bázových párov na sekvenciu aminokyselín, ktoré tvoria bielkoviny. Tento proces sa nazýva translácia.

DNA neopúšťa jadro z rôznych dôvodov. DNA je veľmi dlhá molekula a v chromozómoch je viazaná s bielkovinami, ktoré sa nazývajú históny. mRNA sa naopak môže pohybovať a reagovať s rôznymi bunkovými enzýmami. Po prepise mRNA opúšťa jadro a presúva sa do ribozómov.

Dva druhy nekódujúcich RNA pomáhajú v procese tvorby proteínov v bunke. Sú to transferová RNA (tRNA) a ribozomálna RNA (rRNA).

tRNA

Prenosová RNA (tRNA) je krátka molekula s približne 80 nukleotidmi, ktorá prenáša špecifickú aminokyselinu do polypeptidového reťazca v ribozóme. Pre každú aminokyselinu existuje iná tRNA. Každá z nich má miesto na pripojenie aminokyseliny a antikodón, ktorý zodpovedá kodónu na mRNA. Napríklad kodóny UUU alebo UUC kódujú aminokyselinu fenylalanín.

rRNA

Ribozomálna RNA (rRNA) je katalytickou zložkou ribozómov. Eukaryotické ribozómy obsahujú štyri rôzne molekuly rRNA: 18S, 5,8S, 28S a 5S rRNA. Tri z molekúl rRNA sa syntetizujú v jadre a jedna sa syntetizuje inde. V cytoplazme sa ribozomálna RNA a bielkoviny spájajú do jadrového proteínu nazývaného ribozóm. Ribozóm viaže mRNA a vykonáva syntézu bielkovín. Na jednu mRNA môže byť v každom okamihu pripojených niekoľko ribozómov. rRNA je mimoriadne hojná a tvorí 80 % z 10 mg/ml RNA, ktorá sa nachádza v typickej eukaryotickej cytoplazme.

snRNA

Malé jadrové RNA (snRNA) sa spájajú s proteínmi a vytvárajú spliceozómy. Spliceozómy riadia alternatívne spájanie. Gény kódujú proteíny v častiach nazývaných exóny. Bity sa môžu spájať rôznymi spôsobmi, aby sa vytvorili rôzne mRNA. Z jedného génu tak môže vzniknúť mnoho proteínov. Toto je proces alternatívneho spájania. Všetky nežiaduce verzie proteínu sa rozštiepia proteázami a chemické bity sa znovu použijú.

Štruktúra zrelej eukaryotickej mRNA. Úplne spracovaná mRNA obsahuje 5' čiapočku, 5' UTR, kódujúcu oblasť, 3' UTR a poly(A) chvost. UTR = nepreložená oblasť

Regulačné RNA

Existuje množstvo RNA, ktoré regulujú gény, to znamená, že regulujú rýchlosť, akou sa gény prepisujú alebo prekladajú.

miRNA

Mikro RNA (miRNA) pôsobia tak, že sa pripájajú k enzýmu a blokujú mRNA alebo urýchľujú jej rozpad. Tento postup sa nazýva RNA interferencia.

siRNA

Malé interferujúce RNA (niekedy nazývané tlmiace RNA) zasahujú do expresie konkrétneho génu. Sú to pomerne malé (20/25 nukleotidov) dvojvláknové molekuly. Ich objavenie spôsobilo prudký nárast biomedicínskeho výskumu a vývoja liekov.

Parazitické a iné RNA

Retrotranspozóny

Transpozóny sú len jedným z viacerých typov mobilných genetických prvkov. Retrotranspozóny sa kopírujú v dvoch fázach: najprv z DNA do RNA transkripciou a potom z RNA späť do DNA reverznou transkripciou. Kópia DNA sa potom vloží do genómu na nové miesto. Retrotranspozóny sa správajú veľmi podobne ako retrovírusy, napríklad HIV.

Vírusové genómy

Vírusové genómy, ktoré sú zvyčajne RNA, preberajú bunkové mechanizmy a vytvárajú novú vírusovú RNA aj bielkovinový obal vírusu.

Genómy fágov

Genómy fágov sú pomerne rozmanité. Genetický materiál môže byť ssRNA (jednovláknová RNA), dsRNA (dvojvláknová RNA), ssDNA (jednovláknová DNA) alebo dsDNA (dvojvláknová DNA). Môže byť dlhá od 5 do 500 kilobázových párov s kruhovým alebo lineárnym usporiadaním. Bakteriofágy majú zvyčajne veľkosť od 20 do 200 nanometrov.

Genómy fágov môžu kódovať len štyri gény, ale aj stovky génov.

Používa

Niektorí vedci a lekári použili messengerovú RNA vo vakcínach na liečbu rakoviny a prevenciu ochorení.

Otázky a odpovede

Otázka: Čo znamená skratka RNA?

Odpoveď: RNA znamená ribonukleová kyselina.

Otázka: Ako sa RNA fyzicky líši od DNA?

A: RNA obsahuje len jedno vlákno, zatiaľ čo DNA obsahuje dve navzájom stočené vlákna.

Otázka: Aké rôzne bázy sa nachádzajú v RNA?

Odpoveď: Rôzne bázy, ktoré sa nachádzajú v RNA, sú adenín, guanín, cytozín a uracil.

Otázka: Aký je vzorec väzieb medzi bázami RNA?

Odpoveď: Adenín tvorí väzby s uracilom a guanín tvorí väzby s cytozínom.

Otázka: Ako sa RNA chemicky líši od DNA?

Odpoveď: RNA obsahuje ribózu namiesto deoxyribózy, vďaka čomu je chemicky reaktívnejšia ako DNA.

Otázka: Aká je úloha RNA v bunkových reakciách?

Odpoveď: RNA je vhodnejšia na účasť v bunkových reakciách vďaka svojej chemickej reaktivite.

Otázka: Ktoré vírusy používajú RNA ako nosič genetickej informácie?

Odpoveď: Niektoré vírusy, najmä retrovírusy, ako napríklad vírus HIV, používajú RNA ako nosič genetickej informácie.