Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii je endosymbiotická gama proteobaktéria. Má najmenší známy genóm zo všetkých baktérií.
Tento druh je endosymbiontom, ktorý je prítomný vo všetkých druhoch hmyzu živiaceho sa floemovou šťavou, známych ako psyllidy. Endosymbiont sa vyskytuje v špecializovanej štruktúre známej ako bakterióm.
V roku 2006 bol genóm jedného kmeňa Ca. C. ruddi bol sekvenovaný v RIKEN v Japonsku a na Arizonskej univerzite. Genom je kruhový chromozóm s 159 662 pármi báz a má vysokú hustotu kódovania (97 %) s mnohými prekrývajúcimi sa génmi a zníženou dĺžkou génov. Počet predpovedaných génov bol 182, čo je tiež najnižší zaznamenaný počet (NCBI-Genome). Zdá sa, že mnohé gény považované za nevyhnutné pre život chýbajú, čo naznačuje, že tento druh mohol dosiahnuť status organely.
Pre porovnanie, Mycoplasma genitalium, ktorá má najmenší genóm zo všetkých voľne žijúcich organizmov, má genóm s 521 génmi.
Otázky a odpovede
Otázka: Čo je to Candidatus Carsonella ruddii?
Odpoveď: Candidatus Carsonella ruddii je endosymbiotická gama proteobaktéria, ktorá je prítomná vo všetkých druhoch hmyzu živiaceho sa floemovou šťavou, známych ako psyllidy.
Otázka: Aká je veľkosť genómu Candidatus Carsonella ruddii?
Odpoveď: Genóm Candidatus Carsonella ruddii je najmenší známy genóm akejkoľvek baktérie a predstavuje kruhový chromozóm s 159 662 pármi báz.
Otázka: Koľko génov sa predpokladá v Candidatus Carsonella ruddii?
Odpoveď: Počet predpovedaných génov v Candidatus Carsonella ruddii je 182, čo je najmenej v histórii (NCBI-Genome).
Otázka: Aká je hustota kódovania genómu Candidatus Carsonella ruddii?
Odpoveď: Genóm Candidatus Carsonella ruddii má vysokú hustotu kódovania 97 %.
Otázka: Čo je to bakterióm?
Odpoveď: Bakterióm je špecializovaná štruktúra, v ktorej sa vyskytujú endosymbionti v Candidatus Carsonella ruddii.
Otázka: Čo chýba v genóme Candidatus Carsonella ruddii?
Odpoveď: Zdá sa, že v genóme Candidatus Carsonella ruddii chýbajú početné gény považované za nevyhnutné pre život, čo naznačuje, že tento druh mohol dosiahnuť status organely.
Otázka: Ako vyzerá genóm Candidatus Carsonella ruddii v porovnaní s genómom Mycoplasma genitalium?
Odpoveď: Genóm Mycoplasma genitalium, ktorý má najmenší genóm zo všetkých voľne žijúcich organizmov, má 521 génov, čo je výrazne viac ako počet predpokladaných génov v Candidatus Carsonella ruddii.
