Genóm
Genom organizmu je celá jeho dedičná informácia zakódovaná v DNA (alebo v prípade niektorých vírusov v RNA). Zahŕňa gény aj nekódujúce sekvencie DNA. Tento termín zaviedol v roku 1920 profesor Hans Winkler.
Winklerova definícia v preklade znie:
"Pre haploidný súbor chromozómov navrhujem výraz genóm, ktorý spolu s príslušnou protoplazmou určuje materiálny základ druhu ...." p165
Avšak ani jeden súbor haploidných chromozómov neurčuje DNA druhu. Vzhľadom na obrovskú rozmanitosť alel, ktoré populácia nesie, je každý jedinec geneticky odlišný. Dokonca aj diploidný jedinec nesie genetickú rozmanitosť. Z tohto dôvodu Dobzhansky uprednostnil "súbor chromozómov" a definícia musí byť teraz širšia ako Winklerova definícia. Genóm haploidného súboru chromozómov je len vzorkou celkovej genetickej rozmanitosti druhu.
Termín "genóm" sa môže použiť konkrétne na označenie kompletného súboru jadrovej DNA ("jadrový genóm"), ale môže sa použiť aj na označenie organel, ktoré obsahujú svoju vlastnú DNA, ako napríklad mitochondriálny genóm alebo chloroplastový genóm.
Veľkosti genómu
Organizmus | Veľkosť genómu (páry báz) | Poznámka |
Vírus, bakteriofág MS2 | 3569 | Prvý sekvenovaný RNA-genóm |
Vírus, SV40 | 5224 | |
Vírus, fág Φ-X174 | 5386 | Prvý sekvenovaný DNA-genóm |
Vírus, fág λ | 5×10 4 | |
1.6×10 5 | Najmenší nevírusový genóm, február 2007 | |
Baktéria, Escherichia coli | 4×10 6 | Najlepšie preskúmaná baktéria. |
Baktéria, Solibactoer usitatus | 1×10 7 | Najväčší známy bakteriálny genóm |
Protista, Amoeba dubia | 6.7×10 11 | Najväčší známy genóm, ale sporný. |
Rastlina, Arabidopsis thaliana | 1.57×10 8 | Prvý sekvenovaný genóm rastliny, december 2000. |
Rastlina, Genlisea margaretae | 6.34×10 7 | Najmenší zaznamenaný genóm kvitnúcej rastliny, 2006. |
Rastlina, Fritillaria assyrica | 1.3×10 11 | |
Rastlina, Populus trichocarpa | 4.8×10 8 | Prvý genóm stromu, september 2006 |
Kvasinky, Saccharomyces cerevisiae | 2×10 7 | |
Huby, Aspergillus nidulans | 3×10 7 | |
Nematóda, Caenorhabditis elegans | 9.8×10 7 | Prvý viacbunkový živočíšny genóm, december 1998. |
Hmyz, Drosophila melanogaster alias ovocná muška | 1.3×10 8 | |
Hmyz, Bombyx mori alias priadka morušová | 5.30×10 8 | |
Hmyz, Apis mellifera alias včela medonosná | 1.77×10 9 | |
Ryba, Tetraodon nigroviridis, druh Puffer fish | 3.85×10 8 | Najmenší známy genóm stavovcov |
3×10 9 | ||
Ryba, Protopterus aethiopicus alias mramorovaná pľúcna ryba | 1.3×10 11 | Najväčší známy genóm stavovcov |
Poznámka: DNA z jednej ľudskej bunky má dĺžku ~1,8 m (ale šírku ~2,4 nanometra).
Súvisiace stránky
- Gene
- Analýza sekvencie
- Ľudský genóm
- ENCODE: kompletná analýza ľudského genómu
Otázky a odpovede
Otázka: Čo je to genóm?
Odpoveď: Genom je celá dedičná informácia organizmu zakódovaná v jeho DNA (alebo v prípade niektorých vírusov v RNA). Zahŕňa gény aj nekódujúce sekvencie DNA.
Otázka: Kto vymyslel pojem "genóm"?
Odpoveď: Profesor Hans Winkler vytvoril pojem "genóm" v roku 1920.
Otázka: Čo Winkler definoval ako genóm?
Odpoveď: Winkler definoval genóm ako "haploidný súbor chromozómov, ktorý spolu s príslušnou protoplazmou určuje materiálny základ druhu".
Otázka: Má každý jedinec genetickú rozmanitosť?
Odpoveď: Áno, vďaka alelám, ktoré populácia nesie, je každý jedinec geneticky odlišný. Dokonca aj diploidní jedinci sú nositeľmi genetickej rozmanitosti.
Otázka: Čo znamená, keď hovoríme "jadrový genóm"?
Odpoveď: Keď hovoríme o "jadrovom genóme", myslíme tým konkrétne kompletný súbor jadrovej DNA.
Otázka: Existujú okrem jadrových genómov aj iné genómy?
Odpoveď: Áno, existujú aj mitochondriálne genómy a chloroplastové genómy, ktoré obsahujú vlastnú DNA.