Chemická informatika
Chemická informatika (známa aj ako chemoinformatika a chemická informatika) je štúdium veľkého množstva chemických informácií. Vykonáva sa väčšinou pomocou počítačov. Tieto nástroje používajú farmaceutické spoločnosti na objavovanie nových liekov.
Chemická informatika využíva počítačové vedy a informačné technológie na riešenie chemických problémov. Cheminformatika sa zaoberá algoritmami, databázami a informačnými systémami, webovými technológiami, umelou inteligenciou a soft computingom, teóriou informácií a výpočtov, softvérovým inžinierstvom, dolovaním údajov, spracovaním obrazu, modelovaním a simuláciou, spracovaním signálov, diskrétnou matematikou, teóriou riadenia a systémov, teóriou obvodov a štatistikou, aby sa vytvorili nové poznatky z chémie.
História
Pojem chemoinformatika definoval F. K. Brown v roku 1998:
Základy
Cheminformatika spája vedecké pracovné oblasti chémie a informatiky. Cheminformatiku možno použiť aj na analýzu údajov pre papierenský, celulózový a farbiarsky priemysel.
Používa
Ukladanie a vyhľadávanie
Chemická informatika sa primárne využíva na uchovávanie informácií o zlúčeninách. Efektívne vyhľadávanie takýchto uložených informácií zahŕňa témy, ktorými sa zaoberá informatika ako dolovanie údajov a strojové učenie.
Formáty súborov
Počítače reprezentujú chemické štruktúry v špecializovaných formátoch, ako je napríklad chemický značkovací jazyk založený na XML alebo SMILES. Zatiaľ čo niektoré formáty sú vhodné na vizuálnu reprezentáciu v 2 alebo 3 rozmeroch, iné sú vhodnejšie na štúdium fyzikálnych interakcií, modelovanie a štúdie dokovania.
Virtuálne knižnice
Chemické údaje sa môžu týkať skutočných alebo virtuálnych molekúl. Virtuálne zlúčeniny sa môžu použiť na skúmanie chemického priestoru a predpovedanie nových zlúčenín s požadovanými vlastnosťami.
Virtuálne knižnice tried zlúčenín (liečivá, prírodné produkty, syntetické produkty orientované na diverzitu) boli nedávno vytvorené pomocou algoritmu FOG (fragment optimized growth).
Virtuálne premietanie
Namiesto testovania skutočných chemikálií zahŕňa virtuálny skríning počítačový skríning zlúčenín s cieľom identifikovať zlúčeniny, ktoré pravdepodobne majú požadované vlastnosti, ako je biologická aktivita voči danému cieľu.
Kvantitatívny vzťah štruktúry a aktivity (QSAR)
Ide o predpovedanie aktivity zlúčenín na základe ich štruktúry. Tieto štúdie spájajú chemiofarmatiku s chemometriou. Významné sú aj chemické expertné systémy. Predstavujú časti chemických znalostí v počítačoch.
Otázky a odpovede
Otázka: Čo je to chemická informatika?
Odpoveď: Chemická informatika je štúdium veľkého množstva chemických informácií pomocou počítačov.
Otázka: Aké nástroje sa používajú predovšetkým v chemoinformatike?
Odpoveď: Nástroje používané v chemoinformatike sú počítače.
Otázka: Prečo je chemoinformatika dôležitá?
Odpoveď: Chemoinformatika je dôležitá, pretože ju využívajú farmaceutické spoločnosti na objavovanie nových liekov a na pomoc pri riešení chemických problémov.
Otázka: Čím sa zaoberá chemoinformatika?
Odpoveď: Chemoinformatika sa zaoberá algoritmami, databázami a informačnými systémami, webovými technológiami, umelou inteligenciou a soft computingom, teóriou informácií a výpočtov, softvérovým inžinierstvom, dolovaním údajov, spracovaním obrazu, modelovaním a simuláciou, spracovaním signálov, diskrétnou matematikou, teóriou riadenia a systémov, teóriou obvodov a štatistikou.
Otázka: Ako chemoinformatika vytvára nové poznatky o chémii?
Odpoveď: Chemická informatika vytvára nové poznatky o chémii využívaním informatiky a informačných technológií na analýzu chemických údajov a riešenie problémov súvisiacich s chémiou.
Otázka: Čo je to cheminformatika?
Odpoveď: Cheminformatika je iný názov pre chemoinformatiku.
Otázka: Ako sa chemoinformatika používa na objavovanie nových liekov?
Odpoveď: Farmaceutické spoločnosti využívajú chemickú informatiku na analýzu veľkého množstva chemických údajov a identifikáciu vzorcov, ktoré sa dajú použiť na navrhovanie nových liekov.
