Prvé nápady a plánovanie
Čchen Jü, ktorý bol guvernérom provincie Kuang-tung v rokoch 1957 až 1967, mal prvý nápad na vybudovanie metra v Kantone. V roku 1960 dal skontrolovať hladinu podzemnej vody v Kantone. V roku 1965 Chen Yu a Tao Zhu vyslovili myšlienku vybudovať v Guangzhou tunel na evakuáciu počas vojny alebo na vytvorenie metra. Projekt sa nazýval "Projekt deväť".
Systém metra mal mať dve linky. Chen Yu plánoval severojužnú linku a východozápadnú linku. Plány týchto liniek sú veľmi podobné línii 1 a línii 2. Linka východ-západ nebola nikdy vybudovaná. Severojužná linka mala byť vybudovaná v rámci Projektu 9. Nebolo dosť času, peňazí ani materiálu, takže namiesto metra plánovali použiť trolejbusy. Tunel bol dokončený v roku 1966, ale nemohol sa používať. Dôvodom bol nebezpečný úsek tunela. V 70. rokoch 20. storočia sa uskutočnilo mnoho pokusov o opätovné spustenie projektu Nine, ale ani pri jednom z nich sa projekt Nine neobnovil.
Výstavba linky 1
Projekt metra sa začal ako prípravný úrad metra v Kantone. Vznikla v roku 1979 s cieľom pokúsiť sa o reštartovanie projektu Nine. Projekt mal pomôcť znížiť dopravu v Kantone. Pred rokom 1980 bola väčšina projektov metra v Číne určená na prípravu na vojnu. Bolo to prvýkrát, čo sa niečo také ako metro v Kantone zameralo na dopravu. Čína a Francúzsko spolupracovali na návrhu metra. Štyri návrhy boli zverejnené v denníku Guangzhou Daily 14. marca 1988. Jeden z návrhov bol vybraný po získaní spätnej väzby od ostatných ľudí. Zobrazoval návrh, ktorý sa mal stať linkou 1 a linkou 2.
Výstavba linky 1 sa oficiálne začala 28. decembra 1992. Ešte predtým, v októbri 1992, začali robotníci pracovať na skúšobnej časti trate. Pri výstavbe metra sa použili mnohé stavebné techniky. V Číne boli nové a zahŕňali ponorné rúry a tunelovacie stroje. Na výstavbu linky 1 bolo potrebných 12,75 miliárd jüanov a všetky peniaze získala vláda mesta Guangzhou. Vtedajší starosta Li Ziliu chcel použiť tunely s rúbaním. To znamenalo, že takmer 100 000 ľudí muselo opustiť svoje domovy a takmer 1,1 km2 (0,42 km²) budov muselo byť zničených.
Dňa 28. júna 1997 bol skúšobne otvorený 5,4 km dlhý úsek linky 1. Neotvorená časť v dĺžke 13 km (8,1 míle) bola dokončená 28. decembra 1998. Celá trať bola otvorená pre prehliadky od 16. februára do 2. marca 1999. Linka 1 bola oficiálne otvorená 28. júna 1999.