Pithovirus

Pithovirus je rod obrovského vírusu, ktorý infikuje améby. Je to dvojvláknový DNA vírus a patrí do klanu veľkých DNA vírusov. Prvýkrát bol opísaný v roku 2014 po tom, ako sa našiel životaschopný exemplár v 30 000 rokov starom ľadovom jadre získanom z permafrostu na Sibíri v Rusku.

Je o 50 % väčší ako predchádzajúce najväčšie známe vírusy, ale Pandoravirus má najväčší vírusový genóm, ktorý obsahuje 1,9 až 2,5 megabázy DNA. Pithovirus má hrubú oválnu stenu s otvorom na jednom konci. Vnútorne jeho štruktúra pripomína včelie plásty.

Jeho genóm

Genóm pithovírusu má 467 rôznych génov, čo je viac ako u typického vírusu, ale oveľa menej ako u pandoravírusu. Jeho genóm je oveľa menej husto usporiadaný ako akýkoľvek iný známy vírus. Dve tretiny jeho proteínov sú odlišné od proteínov iných vírusov. Napriek fyzickej podobnosti s Pandoravírusom sekvencia genómu Pithovírusu ukazuje, že je s týmto vírusom sotva príbuzný. Viac sa podobá členom niektorých iných rodín vírusov. Všetky tieto rodiny obsahujú veľké ikosaedrické vírusy s genómami DNA. Genóm pithovírusu má 36 % GC-obsahu, podobne ako genóm Megaviridae, na rozdiel od viac ako 61 % v prípade pandoravírusov.

Replikácia

Genóm pithovírusu je jeden kruhový chromozóm s dvojitým vláknom DNA (dsDNA) s približne 610 000 pármi báz (bp). Genóm kóduje všetky proteíny potrebné na produkciu mRNA; tieto proteíny sú prítomné v purifikovaných viriónoch.

Pithovirus uskutočňuje celý svoj replikačný cyklus v cytoplazme svojho hostiteľa, nie typickým spôsobom, keď sa zmocní jadra hostiteľa.

Vyhľadávanie

Pithovirus sibericum bol objavený v 30 000 rokov starej vzorke sibírskeho permafrostu. Vírus bol objavený pochovaný 30 m (98 stôp) pod povrchom neskoropleistocénneho sedimentu. Zistilo sa to pri vystavení vzoriek z riečnych brehov odobratých v roku 2000 amébam. Améby začali odumierať a zistilo sa, že obsahujú obrovské vírusy. Autori uviedli, že nápad skúmať vzorky permafrostu na prítomnosť nových vírusov dostali po tom, ako sa dočítali o experimente, ktorý pred dvoma rokmi oživil podobne starú náplň.

Hoci je tento vírus pre človeka neškodný, jeho životaschopnosť po tisícročiach zmrazenia vyvolala obavy, že globálne klimatické zmeny a vrtné práce v tundre by mohli viesť k objaveniu potenciálne nebezpečných vírusov. Iní vedci popierajú, že by to predstavovalo reálnu hrozbu.


AlegsaOnline.com - 2020 / 2023 - License CC3