Pithovirus
Pithovirus je rod obrovského vírusu, ktorý infikuje améby. Je to dvojvláknový DNA vírus a patrí do klanu veľkých DNA vírusov. Prvýkrát bol opísaný v roku 2014 po tom, ako sa našiel životaschopný exemplár v 30 000 rokov starom ľadovom jadre získa…
Pithovirus je rod obrovského vírusu, ktorý infikuje améby. Je to dvojvláknový DNA vírus a patrí do klanu veľkých DNA vírusov. Prvýkrát bol opísaný v roku 2014 po tom, ako sa našiel životaschopný exemplár v 30 000 rokov starom ľadovom jadre získanom z permafrostu na Sibíri v Rusku.
Je o 50 % väčší ako predchádzajúce najväčšie známe vírusy, ale Pandoravirus má najväčší vírusový genóm, ktorý obsahuje 1,9 až 2,5 megabázy DNA. Pithovirus má hrubú oválnu stenu s otvorom na jednom konci. Vnútorne jeho štruktúra pripomína včelie plásty.
Galéria obrázkov
2 ObrázkyJeho genóm
Genóm pithovírusu má 467 rôznych génov, čo je viac ako u typického vírusu, ale oveľa menej ako u pandoravírusu. Jeho genóm je oveľa menej husto usporiadaný ako akýkoľvek iný známy vírus. Dve tretiny jeho proteínov sú odlišné od proteínov iných vírusov. Napriek fyzickej podobnosti s Pandoravírusom sekvencia genómu Pithovírusu ukazuje, že je s týmto vírusom sotva príbuzný. Viac sa podobá členom niektorých iných rodín vírusov. Všetky tieto rodiny obsahujú veľké ikosaedrické vírusy s genómami DNA. Genóm pithovírusu má 36 % GC-obsahu, podobne ako genóm Megaviridae, na rozdiel od viac ako 61 % v prípade pandoravírusov.
Replikácia
Genóm pithovírusu je jeden kruhový chromozóm s dvojitým vláknom DNA (dsDNA) s približne 610 000 pármi báz (bp). Genóm kóduje všetky proteíny potrebné na produkciu mRNA; tieto proteíny sú prítomné v purifikovaných viriónoch.
Pithovirus uskutočňuje celý svoj replikačný cyklus v cytoplazme svojho hostiteľa, nie typickým spôsobom, keď sa zmocní jadra hostiteľa.
Vyhľadávanie
Pithovirus sibericum bol objavený v 30 000 rokov starej vzorke sibírskeho permafrostu. Vírus bol objavený pochovaný 30 m (98 stôp) pod povrchom neskoropleistocénneho sedimentu. Zistilo sa to pri vystavení vzoriek z riečnych brehov odobratých v roku 2000 amébam. Améby začali odumierať a zistilo sa, že obsahujú obrovské vírusy. Autori uviedli, že nápad skúmať vzorky permafrostu na prítomnosť nových vírusov dostali po tom, ako sa dočítali o experimente, ktorý pred dvoma rokmi oživil podobne starú náplň.
Hoci je tento vírus pre človeka neškodný, jeho životaschopnosť po tisícročiach zmrazenia vyvolala obavy, že globálne klimatické zmeny a vrtné práce v tundre by mohli viesť k objaveniu potenciálne nebezpečných vírusov. Iní vedci popierajú, že by to predstavovalo reálnu hrozbu.
Súvisiace články
Autor
AlegsaOnline.com Pithovirus Leandro Alegsa
URL: https://sk.alegsaonline.com/art/77132
Zdroje
- viralzone.expasy.org : Viral Zone: Pithovirus sibericum
- doi.org : 10.1038/nature.2014.14801
- bbc.com : "30,000-year-old giant virus 'comes back to life'"
- news.nationalgeographic.com : "Ancient "giant virus" revived From Siberian permafrost"
- npr.org : "World's biggest virus may have ancient roots"
- virology.ws : "Pithovirus: bigger than Pandoravirus with a smaller genome"
- pnas.org : Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology | PNAS
- newscientist.com : "Biggest-ever virus revived from Stone Age permafrost" · web.archive.org
- nytimes.com : "Out of Siberian ice, a virus revived"
- doi.org : 10.1073/pnas.1320670111