Veľká tmavá škvrna (známa aj ako GDS-89) je tmavá škvrna na Neptúne podobná Jupiterovej Veľkej červenej škvrne. Bola objavená v roku 1989 sondou NASA Voyager 2. Hoci sa zdá byť podobná Jupiterovej škvrne, ktorá je anticyklonálnou búrkou (to je ako hurikán), predpokladá sa, že Veľká tmavá škvrna je atmosférická diera podobná diere v ozónovej vrstve Zeme.
Vnútorné strany veľkých tmavých škvŕn sú však väčšinou bez mrakov a na rozdiel od Jupiterovej škvrny, ktorá trvá stovky rokov, sa zdá, že ich životnosť je oveľa kratšia a vznikajú a miznú približne raz za niekoľko rokov. Na základe snímok zhotovených sondou Voyager a odvtedy Hubblovým vesmírnym ďalekohľadom sa zdá, že Neptún strávi s Veľkou tmavou škvrnou o niečo viac ako polovicu svojho času.
