Haploskupina je skupina jednotlivých chromozómov alebo jednotlivých vlákien DNA, ktoré majú spoločného predka. Vo všetkých verziách majú rovnaké mutácie.
Haploskupiny vykazujú hlboký pôvod predkov, ktorý siaha tisíce rokov do minulosti.
V ľudskej genetike sa zvyčajne študujú haploskupiny Y-chromozómu (Y-DNA) a haploskupiny mitochondriálnej DNA (mtDNA). Obe sa môžu použiť na definovanie genetických populácií. Y-DNA sa prenáša len z otca na syna, zatiaľ čo mtDNA sa prenáša len z matky na deti. Ani jedna z nich sa nerekombinuje, a preto sa Y-DNA a mtDNA menia len náhodnými mutáciami bez miešania genetického materiálu rodičov.

