Spoločná biochémia a genetický kód
Všetky známe formy života sú založené na rovnakej základnej biochemickej organizácii.
Genetická informácia je zakódovaná v DNA a prepisuje sa do RNA, potom sa prekladá do proteínov pomocou (veľmi podobných) ribozómov, pričom zdrojom energie je ATP, NADH a iné.
Medzi podobnosti patrí nosič energie adenozíntrifosfát (ATP) a skutočnosť, že všetky aminokyseliny nachádzajúce sa v proteínoch sú ľavostranné (chiralita).
Okrem toho je genetický kód ("prekladová tabuľka", podľa ktorej sa informácie z DNA prekladajú do bielkovín) takmer identický pre všetky známe formy života, od baktérií až po človeka.
Univerzálnosť tohto kódu považujú biológovia vo všeobecnosti za definitívny dôkaz v prospech teórie univerzálneho spoločného pôvodu. Analýza malých rozdielov v genetickom kóde tiež poskytla podporu pre univerzálny spoločný pôvod. Štatistické porovnanie rôznych alternatívnych hypotéz ukázalo, že univerzálny spoločný pôvod je podstatne pravdepodobnejší ako modely zahŕňajúce viacero pôvodov.
Fylogenetické stromy
Ďalším dôležitým dôkazom je, že je možné zostaviť podrobné fylogenetické stromy (t. j. "genealogické stromy" druhov), ktoré mapujú navrhované rozdelenia a spoločných predkov všetkých žijúcich druhov. V roku 2010 analýza dostupných genetických údajov, ktorá ich mapovala na fylogenetické stromy, poskytla "pevnú kvantitatívnu podporu pre jednotu života. ...v súčasnosti existuje silná kvantitatívna podpora, na základe formálneho testu, pre jednotu života.
Tradične sa tieto stromy vytvárali pomocou morfologických metód, ako je porovnávacia anatómia, embryológia atď. V poslednom čase je možné tieto stromy konštruovať aj pomocou molekulárnych údajov na základe podobností a rozdielov medzi genetickými a proteínovými sekvenciami. Všetky tieto metódy poskytujú v podstate podobné výsledky. To, že sa fylogenetické stromy založené na rôznych typoch informácií navzájom zhodujú, je silným dôkazom základného spoločného pôvodu.