Prvá časť metra nahradila veľmi frekventovanú električkovú trať a viedla po ulici Yonge od Eglinton Avenue na juh po ulicu Front Street, potom sa otočila na západ o jeden blok a končila na ulici Bay Street, vedľa hlavnej mestskej železničnej stanice Union Station, a preto sa stanica metra nazývala aj Union. Táto trať bola dokončená v roku 1954 a bola dlhá 7,4 km.
V roku 1963 pribudla ďalšia časť, ktorá viedla severne od stanice Union, popod University Avenue a Queen's Park do blízkosti Bloor Street, kde sa otočila na západ a končila na uliciach St.George a Bloor.
Linka Bloor-Danforth bola otvorená v roku 1966 pozdĺž Bloor Street a Danforth Avenue od Keele Street po Woodbine Avenue a v roku 1968 bola predĺžená a viedla z Islington Avenue do stanice Warden na Warden a St.Clair Avenues.
Trasovanie trate cez údolie rieky Don bolo možné vďaka rozhodnutiu spred viac ako štyridsiatich rokov. Keď bol v roku 1919 cez rieku Don postavený viadukt Princa Edwarda, jeho konštrukcia zahŕňala dve poschodia pod cestou, aby umožnila budúce železničné trate. To umožnilo, aby metro prešlo cez Don Valley na Danforth Avenue na východnej strane.
V rokoch 1973 a 1974 bola trať Yonge-University predĺžená na sever o 8,7 km z Eglinton Avenue na Finch Avenue a Yonge.
Ďalšia trať (9,9 km) pribudla na trati Yonge-University Line v roku 1978, keď bola predĺžená z ulice St. George a Bloor na sever a severozápad k Eglinton Avenue a Allen Road, potom na sever stredom Allen Road k Wilson Avenue.
V októbri 1976 zničil podpaľač (úmyselne založený požiar) vagóny metra a poškodil stanicu Christie. To spôsobilo uzavretie linky Bloor-Danforth na tri dni a stanica Christie bola na určitý čas uzavretá kvôli opravám. V roku 1980 pribudli ďalšie koľaje na oboch koncoch linky Bloor-Danforth. Každé z týchto predĺžení pridalo jednu stanicu, autobusové zálivy a na východnom konci priestor na pripojenie k trati Scarborough RT.
Trať Scarborough RT so šiestimi stanicami na 6,8 km trate je takmer celá postavená nad zemou, nemá priame spojenie s ostatnými traťami a využíva iné vlaky. Používa vlaky Intermediate Capacity Transit System (ICTS), ktoré sú veľmi odlišné od vlakov metra. Trasa je úplne oddelená od cestnej premávky a chodcov, stanice sú plne kryté a vlaky majú veľa dverí, ktoré využívajú vysoké nástupištia.
Na severnom konci časti linky Yonge-University-Spadina na trase Spadina pribudlo ďalších 1,6 km a jedna stanica (Downsview) s parkoviskom pre autobusy.
V auguste 1995 sa v metre TTC stala naozaj vážna nehoda na linke Yonge-University-Spadina Line južne od stanice St.Clair West, ktorú nazýva Russell Hill. Zomreli tri ženy a 100 ľudí bolo zranených, z toho niekoľko ťažko.
Najnovšia linka metra Sheppard bola otvorená v roku 2002. Vedie 5,5 km na východ pod Sheppard Avenue zo stanice Sheppard na linke Yonge (teraz Sheppard-Yonge) do stanice Don Mills na Sheppard a Don Mills Road. Linka Sheppard má menej používateľov ako ostatné dve linky metra a premávajú na nej kratšie vlaky.
Vo viac ako päťdesiatročnej histórii sa prvé dieťa narodilo na nástupišti stanice metra TTC len nedávno, 6. februára 2006. Tento incident sa stal na stanici Wellesley a spôsobil meškanie v systéme metra. Táto udalosť bola mnoho dní na titulných stranách novín.
Pribudol automatický hlasový systém, ktorý oznamoval každú stanicu (napríklad: "Ďalšia stanica je Bloor, Bloor station."), vďaka čomu už nebolo potrebné, aby každú zastávku oznamoval vlakový dispečer. Automatický systém sa používa v celom systéme metra a RT.
