Devan Nair
Devan Nair, tretí singapurský prezident, ktorý žil v exile v Kanade, v roku 1999 v rozhovore pre torontský denník The Globe and Mail poznamenal, že Leeho technika žalovania svojich oponentov do bankrotu alebo do zabudnutia bola zrušením politických práv. Poznamenal tiež, že Lee je "čoraz sebavedomejší vševed", obklopený "panákmi z obchodného domu". V reakcii na tieto poznámky Lee zažaloval Devana Naira na kanadskom súde a Nair podal protižalobu. Lee potom podal návrh na zamietnutie Nairovej protižaloby na súde. Lee tvrdil, že Nairova protižaloba nezverejnila žiaden rozumný dôvod žaloby a predstavovala podnetný útok na integritu singapurskej vlády. Najvyšší súd v Ontáriu však odmietol zamietnuť Nairovu protižalobu a rozhodol, že Lee zneužil súdny proces, a preto Nair má opodstatnený dôvod na podanie žaloby.
Islam
V roku 2011 WikiLeaks zverejnil diplomatické správy, v ktorých sa Leeovi pripisujú kontroverzné výroky o islame. Wikileaks citovali Leeho, ktorý označil islam za "jedovaté náboženstvo". Lee neskôr tieto poznámky poprel.
Tento incident nasledoval po vydaní Leeho kontroverznej knihy Lee Kuan Yew: tvrdé pravdy, ktoré udržujú Singapur v chode. Lee v knihe tvrdil, že singapurskí moslimovia čelia ťažkostiam pri integrácii kvôli svojmu náboženstvu, a vyzval ich, aby "boli menej prísni, pokiaľ ide o dodržiavanie islamu". Uviedol: "V tejto knihe sa píše o tom, že Lee sa snaží o to, aby sa mu darilo:
"Musím hovoriť úprimne, aby to malo hodnotu, ale nechcem uraziť moslimskú komunitu.
Myslím, že sme napredovali veľmi dobre, kým neprišiel príliv islamu, a ak sa ma pýtate na moje pozorovania, ostatné komunity sa integrujú ľahšie - priatelia, manželstvá a tak ďalej, Indovia s Číňanmi, Číňania s Indmi - ako moslimovia. To je výsledok prílivu z arabských štátov.
Povedal by som, že dnes môžeme integrovať všetky náboženstvá a rasy okrem islamu.
Myslím si, že moslimovia zo sociálneho hľadiska nespôsobujú žiadne problémy, ale sú odlišní a oddelení...
Ale teraz chodíte do škôl s malajskými a čínskymi žiakmi, je tam halal a nehalal segment a rovnako aj na univerzitách. A majú tendenciu sedieť oddelene, aby sa nekontaminovali. To všetko sa stáva sociálnym rozdelením...
Buďte menej prísni v dodržiavaní islamu a povedzte: "Dobre, budem jesť s vami."
Podľa bývalého premiéra Goh Chok Tonga singapurskí moslimovia prispôsobili svoje náboženské praktiky jedinečným podmienkam v Singapure.
Politika etnickej integrácie sa zaviedla aj preto, aby sa zabránilo vytváraniu etnických get v singapurských bytoch HDB. V každom okrsku museli žiť obyvatelia všetkých etnických skupín podľa národného pomeru.
Rozsudok o urážke na cti
Dňa 24. septembra 2008 singapurský najvyšší súd v súhrnnom rozsudku sudcu Woo Bih Li rozhodol, že časopis Far Eastern Economic Review (FEER) (redaktor Hugo Restall) ohováral Leeho a jeho syna, premiéra Lee Hsien Loonga. Súd rozhodol, že článok z roku 2006 "Singapurský 'mučeník': Chee Soon Juan" znamenal, že Lee Kuan Yew "riadil a naďalej riadi Singapur rovnakým skorumpovaným spôsobom, ako T. T. Durai riadil Národnú nadáciu pre obličky (NKF), a že využíva urážky na cti na potlačenie tých, ktorí by spochybňovali, aby sa vyhli odhaleniu jeho korupcie". Súd odsúdil spoločnosť FEER, ktorú vlastní Dow Jones & Company (tú zasa vlastní News Corp Ruperta Murdocha), na zaplatenie odškodného sťažovateľom. Spoločnosť FEER sa odvolala, ale prípad prehrala, keď odvolací súd v októbri 2009 rozhodol, že Far Eastern Economic Review skutočne hanobil zakladateľa krajiny Lee Kuan Yew a jeho syna, premiéra Lee Hsien Loonga.