Dakotovia žili v 17. storočí vo Wisconsine a Minnesote. Do roku 1700 sa časť z nich presťahovala do dnešnej Južnej Dakoty. Koncom 17. storočia sa Dakotovia spojili s francúzskymi obchodníkmi. Francúzi sa snažili využiť toto spojenectvo, aby im pomohlo kontrolovať severoamerický obchod s kožušinami proti Angličanom.
Vojna v Dakote v roku 1862
Koncom 50. rokov 19. storočia viedlo porušovanie zmlúv zo strany Spojených štátov a nespravodlivé platby zo strany indiánskych agentov (vládnych osôb, ktoré mali povolenie komunikovať s domorodcami) k rastúcemu hladu a ťažkostiam medzi Dakotami. Aj keď sa Dakotovia pokúšali s vládou USA vyjednávať, nič sa im nepodarilo. Dňa 16. augusta 1862 skupina dakotských lovcov zabila rodinu osadníkov. To viedlo k ďalším útokom na osadníkov a čoskoro sa začala úplná vojna. Dňa 5. novembra 1862 bolo 38 dakotských bojovníkov odsúdených na trest smrti obesením. Táto poprava sa neskôr stala najväčšou hromadnou popravou v dejinách USA.
Počas povstania a po ňom mnohí Východní Dakotovia a ich rodiny opustili Minnesotu a Východnú Dakotu a odišli do Kanady alebo sa usadili v údolí rieky James v krátkodobej rezervácii. Potom sa museli presťahovať do rezervácie Crow Creek na východnom brehu rieky Missouri. Niektorí sa pripojili k Západným Dakotom a presunuli sa ďalej na západ, aby pomohli lakotským kmeňom pokračovať v boji proti americkej armáde.
Ostatní zostali v Minnesote a na východe v malých rezerváciách, ktoré stále existujú, vrátane rezervácií Sisseton-Wahpeton, Flandreau a Devils Lake (Spirit Lake alebo Fort Totten) v Dakote. Niektorí sa presťahovali do Nebrasky, kde má dnes kmeň Santee Sioux rezerváciu na južnom brehu rieky Missouri.
Tí, ktorí utiekli do Kanady, zanechali pre svoje rodiny deväť malých rezervácií v Manitobe (Sioux Valley, Long Plain, Dakota Tipi, Birdtail Creek a Oak Lake [Pipestone]) a ďalšie štyri (Standing Buffalo, Moose Woods [White Cap], Round Plain [Wahpeton] a Wood Mountain) v Saskatchewane.