SARS-CoV-2 — vírus spôsobujúci COVID-19
Prehľadný článok o víruse SARS‑CoV‑2: charakteristika, genetika, pravdepodobný pôvod, prejavy ochorenia COVID‑19, diagnostika, prevencia a význam pre verejné zdravie.
Prehľad
SARS‑CoV‑2 je nový koronavírus, ktorý bol identifikovaný na konci roka 2019 ako pôvodca ochorenia COVID‑19. Ide o obalený, pozitívne orientovaný jednovláknový RNA vírus, známy v skorších správach aj pod názvom 2019‑nCoV. Oficiálnu klasifikáciu a odporúčania týkajúce sa pomenovania poskytla WHO a ďalšie medzinárodné inštitúcie. Koronavírus v tomto kontexte označuje skupinu vírusov, medzi ktoré patrí aj SARS‑CoV‑2, zatiaľ čo termín RNA vystihuje jeho genetický materiál.
Galéria obrázkov
10 ObrázkyStavba a genetika
SARS‑CoV‑2 patrí medzi betakoronavírusy a má relatívne veľký RNA genom (asi desiatky tisíc nukleotidov), ktorý kóduje proteíny dôležité pre replikáciu a prechod do hostiteľskej bunky. Typickými sú obalový glykoproteín (spike, S), ktorý rozpoznáva receptor ACE2 na povrchu buniek, a ďalšie štruktúrne proteíny označované M, E a N. Mutácie v géne pre spike proteín výrazne ovplyvnili šíriteľnosť a imunologické vlastnosti jednotlivých variantov vírusu.
Vznik a šírenie
Prvé hlásenia o neznámom zápalovom ochorení dýchacích ciest boli medzinárodným organizáciám oznámené koncom decembra 2019. Konkrétna lokalita spojená s časnými prípadmi bola veľtrh Huanan v meste Wuhan, avšak otázka presného zdroja a mechanizmu prenosu na človeka zostáva predmetom výskumu. Vírus sa pravdepodobne preniesol zo zvieracieho rezervoára na človeka (zoonóza); diskusie o možných medzihostiteľoch prebiehajú a nie je potvrdené, že daný trh bol primárnym zdrojom pandémie. Úvodné označenie „nový koronavírus 2019“ sa používalo v prvých fázach monitorovania a oznamovania prípadov (2019新型冠狀病毒).
Prejavy, diagnostika a liečba
Klinický obraz ochorenia COVID‑19 sa pohybuje od asymptomatických infikovaní až po závažné zápaly pľúc a systémové komplikácie. Inkubačné obdobie a priebeh sú variabilné; riziko ťažkého priebehu zvyšuje starší vek a pridružené choroby. Diagnostika spočíva najmä v molekulárnych testoch, ktoré detegujú vírusovú RNA (napr. PCR), a v antigénových testoch, ktoré zisťujú vírusové proteíny; serologické testy hodnotia protilátkové odpovede. Liečba zahŕňa podpornú starostlivosť, v niektorých prípadoch antivirotiká alebo monoklonálne protilátky, podľa dostupných odporúčaní a stavu pacienta.
Prevencia a verejné zdravie
Kontrola šírenia SARS‑CoV‑2 závisí od kombinácie zásahov: očkovania, respirátorov alebo rúšok v rizikových situáciách, vetrania vnútorných priestorov, testovania a izolácie potvrdených prípadov. Vakcíny vyvinuté počas pandémie významne znížili riziko ťažkého priebehu a hospitalizácií. Verejné zdravie sa sústredí na sledovanie variantov, rýchle testovanie a očkovacie kampane vedené národnými a medzinárodnými organizáciami (Svetová zdravotnícka organizácia).
Dôležité rozlíšenia a poznámky
- SARS‑CoV‑2 sa líši od pôvodného vírusu SARS‑CoV, hoci sú príbuzné a zdieľajú časť génov.
- Variabilita vírusu vedie k vzniku variantov s rôznymi vlastnosťami — niektoré sú viac prenosné, iné čiastočne unikajú imunitnej odpovedi.
- Chronologické a epidemiologické prehľady prvej fázy prepuknutia sú dostupné v odborných správach a archívoch (epidémia 2019–20).
Pre ďalšie overené informácie a odporúčania o SARS‑CoV‑2 a COVID‑19 možno sledovať pravidelné aktualizácie zdravotníckych autorít a odborných publikácií (viac o koronavírusoch, o skupine koronavírusov, o RNA vírusoch).
Pôvod
Genetický materiál tohto vírusu vykazoval mnoho podobností s vírusom SARS-CoV (79,5 %) a netopierími koronavírusmi (96 %). To znamená, že vírus mohol pôvodne pochádzať z netopierov. Vedci vykonali ďalšie experimenty, ktoré ukázali, že vírus sa pravdepodobne dostal z netopierov do medzihostiteľa, teda iného živočícha medzi netopiermi a ľuďmi. Vírusy v tomto inom zvierati sa časom menili, až kým nemohli infikovať ľudí. Vedci sú si takmer istí, že pôvodným živočíchom bol netopier, ale nie sú si istí, čo bolo tým medzičlánkom. Niektorí vedci si myslia, že to mohol byť pangolin, pretože v pangolínoch žijú koronavírusy, aj keď nie sú presne také isté ako SARS-CoV-2 alebo tie v netopieroch. Pangolíny sú ohrozeným druhom a ich nákup, predaj alebo premiestňovanie z miesta na miesto je v Číne a mnohých ďalších krajinách nezákonné. Ich šupiny sú však zložkou mnohých tradičných čínskych liekov, preto sa často predávajú na čiernom trhu.
Názov
Začiatkom februára 2020 dala študijná skupina pre koronavírusy Medzinárodného výboru pre taxonómiu vírusov oficiálny názov SARS-CoV-2, čo znamená koronavírus náhleho akútneho respiračného syndrómu číslo dva. Predtým sa vírus nazýval "2019-nCoV", čo znamená "nový (nový) koronavírus, ktorý sa objavil v roku 2019". Študijná skupina zvolila tento názov, pretože nový vírus bol veľmi podobný inému vírusu, ktorý sa už nazýval SARS-CoV bez čísla.
Ako vírus spôsobuje ochorenie
Rozširujúca sa časť pľúc, pľúcne alveoly, má dva hlavné typy buniek. Jedna bunka, typ I, absorbuje zo vzduchu, t. j. vymieňa plyny. Druhá, typ II, produkuje povrchovo aktívne látky, ktoré pomáhajú udržiavať pľúca tekuté, čisté, bez infekcií atď. COVID-19 si nájde cestu do bunky produkujúcej surfaktant typu II a zadusí ju tým, že v nej rozmnoží vírus COVID-19. Každá bunka typu II, ktorú vírus zabije, spôsobí v pľúcach extrémnu reakciu. Tekutiny, hnis a odumretý bunkový materiál zaplavia pľúca a spôsobia koronavírusové pľúcne ochorenie.
Poškodenie pľúc
Vedci skúmali pľúca ľudí, ktorí zomreli na COVID-19. Porovnali ich s pľúcami ľudí, ktorí zomreli na chrípku typu A, a s pľúcami ľudí, ktorí zomreli, ale nemali žiadne problémy s pľúcami. Zistili, že bunky, ktoré tvoria kožu ciev v pľúcach, boli v pľúcach pacientov s COVID-19 viac poškodené a dochádzalo k väčšej zrážanlivosti krvi. Najdôležitejším rozdielom, ktorý vedci videli, bolo, že v pľúcach začali rásť nové cievy.
COVID-19
Vo februári 2020 Svetová zdravotnícka organizácia oznámila, že pre ochorenie spôsobené vírusom SARS-CoV-2 zvolila názov COVID-19. "Covi" ako "coronavirus", "D" ako "choroba" a "19" ako rok 2019. Povedali, že nechceli, aby názov obsahoval nejakú osobu, miesto alebo zviera, ako napríklad "Wuhan" alebo "pangolin", pretože potom by ľudia mohli z ochorenia obviňovať dané miesto, osobu alebo zviera. Chceli tiež, aby sa názov dal ľahko vysloviť nahlas.
Príznaky
Podľa amerického Centra pre kontrolu a prevenciu chorôb spôsobuje COVID-19 ľuďom rôzne ťažkosti, ale zvyčajne postihuje pľúca. Ľudia zvyčajne kašlú a majú ťažkosti s dýchaním. Často majú aj horúčku, zimnicu, bolesť hlavy, bolesť svalov alebo problémy s chuťou či vôňou.
Podľa štúdie Americkej gastroenterologickej asociácie z apríla 2020 môže COVID-19 u chorých ľudí vyvolať zvracanie alebo hnačku, ale je to zriedkavé. Uviedli, že približne 7,7 % pacientov s COVID-19 zvracalo, približne 7,8 % malo hnačku a približne 3,6 % malo bolesti žalúdka.
Tvar
Vírus SARS-CoV-2 vyzerá ako guľatá guľa s hrotmi po celom obvode. Vírus sa skladá zo štyroch častí: hrotov, membrány, obalu a genetického materiálu vírusu alebo ribonukleovej kyseliny (RNA). Hroty, membrána a obal sa spoločne nazývajú vírusový obal alebo vonkajšia vrstva vírusu.
Proteín hrotu sa prilepí na miesto na ľudskej bunke nazývané receptor. Tento receptor sa nazýva angiotenzín konvertujúci enzým 2 (ACE2). ACE2 sa nachádza na bunkách pľúc, obličiek a čriev. Po prilepení proteínu hrotu na receptor ACE2 sa vírus a bunkové membrány spoja.
SARS-CoV-2 je vírus s pozitívnym reťazcom RNA, čo znamená, že používa kyselinu ribonukleovú (RNA) na uchovávanie vzorcov na výrobu potrebných proteínov namiesto DNA, ako to robia ľudia a iné viacbunkové živé organizmy.
Konšpiračné teórie
Začiatkom roka 2020 si niektorí ľudia začali myslieť, že vírus SARS-CoV-2 mohol byť zámerne vyrobený v laboratóriu Wuhanského virologického inštitútu a vypustený vo Wuhane ako zbraň. Keď vodca Iránu ajatolláh Chameneí povedal, že nechce, aby Spojené štáty pomohli jeho krajine proti koronavírusu, ako jeden z dôvodov uviedol myšlienku, že Američania vyrobili vírus zámerne, aby uškodili Iráncom: "Neviem, nakoľko je toto obvinenie reálne, ale keď existuje, kto so zdravým rozumom by vám veril, že im prinesiete lieky?" povedal Chameneí.
Jeden z prieskumov Pew Research ukázal, že 29 % Američanov, ktorí odpovedali, si myslí, že SARS-CoV-2 mohol byť vyrobený v laboratóriu zámerne, a 23 % si myslí, že mohol byť vyrobený v laboratóriu náhodne. Prieskum medzi ľuďmi v Spojenom kráľovstve ukázal, že mnohí z nich si myslia, že COVID-19 spôsobili bezdrôtové siete 5G.
17. marca 2020 vedci z Kolumbijskej univerzity a ďalších miest uverejnili v časopise Nature Medicine článok, ktorý dokazuje, že vírus SARS-CoV-2 takmer určite nevyrobili ľudia v laboratóriu. Dosiahli to vzájomným porovnaním genómov rôznych vírusov. Vedci zistili, že SARS-CoV-2 sa nezhoduje so žiadnou z vírusových kostier, ktoré už virológovia majú k dispozícii.
Lieky
V apríli 2020 vedci z Pittsburskej univerzity uviedli, že vytvorili vakcínu s názvom PittCoVacc a testovali ju na myšiach.
Ďalší tím vedcov pod vedením Dr. Josefa Penningera z Univerzity v Britskej Kolumbii vynašiel liek s názvom APN01 a testoval ho na upravenom ľudskom tkanive, čo znamená, že ľudské bunky boli v laboratóriu zostavené tak, aby vyzerali a správali sa ako v tele. Vedci zistili, že pridaním rozpustného ľudského rekombinantného angiotenzín konvertujúceho enzýmu 2 (ACE2) do týchto tkanív infikovaných vírusom SARS-CoV-2 sa vírus ťažšie rozmnožuje.
Koncom apríla 2020 tím z Oxfordskej univerzity oznámil, že vyvinul vakcínu proti COVID-19. Národné ústavy zdravia Spojených štátov ju testovali na opiciach rodu Rhézus a fungovala. Vedci z Oxfordu uviedli, že keďže už pracovali na vakcíne proti inému koronavírusu, mali náskok pri práci na vakcíne proti SARS-CoV-2. Vedci uviedli, že sa pokúsia otestovať svoju vakcínu na 6 000 ľuďoch do konca mája 2020 a že ich vakcína by mohla byť pripravená na použitie ľuďmi v septembri 2020.
V polovici mája 2020 spoločnosť Moderna uviedla, že testovala svoju vakcínu mRNA na štyridsiatich piatich ľuďoch a u ôsmich z nich sa vytvorili protilátky, ale konkrétne údaje nezverejnila ani neuverejnila článok vo vedeckom časopise. Anna Durbinová z Univerzity Johnsa Hopkinsa uviedla, že je príliš skoro na to, aby sa dalo povedať, či si ľudia udržia protilátky dostatočne dlho na to, aby vakcína fungovala. Úrad pre kontrolu potravín a liečiv Spojených štátov amerických povolil spoločnosti Moderna opätovné testovanie vakcíny na väčšom počte ľudí. Lekársky riaditeľ spoločnosti Moderna uviedol, že vakcína by mohla byť hotová v januári 2021.
Hydroxychlorochín
Niektorí ľudia si myslia, že hydroxychlorochín, liek podávaný ľuďom s maláriou, lupusom a artritídou, by mohol pôsobiť proti COVID-19 a niektorí si to nemyslia. Jedna štúdia z Číny ukázala, že pacienti s COVID-19, ktorí užívali hydroxychlorochín, sa rýchlejšie uzdravili, ale štúdia nebola odborne posúdená. Zdá sa, že iné štúdie vo Francúzsku a Číne ukázali, že hydroxychlorochín pomáha, ale štúdie nezahŕňali kontrolné skupiny, čo znamená, že lekári neporovnávali pacientov, ktorí užívali hydroxychlorochín, s pacientmi, ktorí ho neužívali, takže si nemohli byť istí, či im pomáha práve hydroxychlorochín, alebo niečo iné. V marci Úrad pre kontrolu potravín a liečiv Spojených štátov amerických povolil lekárom podávať hydroxychlorochín pacientom s COVID-19.
Prezident Spojených štátov Donald Trump navrhol, že liek proti malárii hydroxychlorochín by mohol pomôcť pri liečbe COVID-19, ale doktor Anthony Fauci, ktorý je súčasťou oficiálneho tímu Bieleho domu pre koronavírusy, povedal, že nikto nemôže vedieť, či hydroxychlorochín funguje proti SARS-CoV-2. Začiatkom apríla denník New York Times uviedol, že prezident Trump má "malý osobný finančný záujem" v spoločnosti Sanofi, jednej zo spoločností, ktorá vyrába hydroxychlorochín, čo znamená, že ak by spoločnosť predala viac hydroxychlorochínu, mal by väčší majetok.
Začiatkom apríla Fauci povedal: "Tieto údaje sú v najlepšom prípade len orientačné. Vyskytli sa prípady, ktoré ukazujú, že účinok môže existovať, a sú aj iné, ktoré ukazujú, že účinok neexistuje." Doktorka Megan L. Ranneyová z Brownovej univerzity uviedla, že hydroxychlorochín môže spôsobiť srdcové príhody a iné problémy. Iní lekári sa obávajú, že ak budú ľudia užívať hydroxychlorochín na COVID-19, nezostane dostatok pre ľudí s maláriou, lupusom a artritídou. Napriek tomu niektoré nemocnice podávajú hydroxychlorochín pacientom s COVID-19, ktorí sú veľmi chorí, pretože lekári si myslia, že to stojí za to riziko.
Vedci vo Francúzsku a Číne vykonali ďalšie štúdie na väčších skupinách pacientov užívajúcich hydroxychlorochín. Sledovali pacientov, ktorí užívali liek a inú liečbu spolu, a na pacientoch, ktorí užívali len inú hrozbu. Obe štúdie ukázali, že hydroxychlorochín nepomáha a spôsobuje vedľajšie účinky. Obe štúdie boli uverejnené v máji 2020.
Remdesivir
Niektorí vedci si tiež myslia, že liek remdesivir, ktorý bol vynájdený ako liek proti ebole, by mohol fungovať aj proti SARS-CoV-2. Remdesivir pôsobí aj proti iným vírusom a bol už testovaný na ľuďoch, takže lekári už vedeli, že pacientom neublíži, aj keď im nepomôže. Keďže vedci už vedeli, že remdesivir je bezpečný, mohli ho hneď začať testovať na ľuďoch.
Lekári podali liek s názvom remdesivir 61 pacientom s COVID-19 zo súcitu, čo znamená, že im ho podali, pretože nebola k dispozícii iná liečba. Vedci skúmali 53 z týchto pacientov a zistili, že 68 % pacientov sa zlepšilo, 13 % zomrelo a 25 % malo vážne vedľajšie účinky. Keďže však štúdia nemala žiadnu kontrolnú skupinu, čo znamená, že títo pacienti neboli porovnávaní s inými pacientmi s COVID-19, ktorí remdesivir neužívali, a keďže experimentu sa zúčastnilo len 53 ľudí, vedci musia vykonať ďalšie štúdie, aby si mohli byť istí, že remdesivir funguje.
Predseda predstavenstva a generálny riaditeľ spoločnosti, ktorá vyrába remdesivir, David O'Day, uviedol, že remdesivir môže u niektorých pacientov fungovať lepšie ako u iných, a požiadal vedcov, aby vykonali rôzne druhy štúdií.
Otázky a odpovede
Otázka: Čo je SARS-CoV-2?
Odpoveď: SARS-CoV-2 je pozitívny jednovláknový RNA koronavírus, ktorý spôsobuje ochorenie COVID-19.
Otázka: Ako bol známy predtým?
Odpoveď: Svetová zdravotnícka organizácia (WHO) ho predtým označovala ako nový koronavírus 2019 (2019-nCoV).
Otázka: Kedy boli hlásené prvé podozrivé prípady?
Odpoveď: Prvé podozrivé prípady boli WHO nahlásené 31. decembra 2019.
Otázka: Odkiaľ pochádzalo mnoho prvých prípadov tohto nového koronavírusu?
Odpoveď: Mnohé prvé prípady tohto nového koronavírusu boli spojené s veľkoobchodným trhom s morskými plodmi Huanan Seafood, veľkým trhom s morskými plodmi a zvieratami v čínskom meste Wuhan.
Otázka: Je isté, že toto miesto bolo zdrojom pandémie?
Odpoveď: Nie, nie je isté, že toto miesto bolo zdrojom pandémie.
Otázka: Aký typ vírusu je SARS-CoV-2?
Odpoveď: SARS-CoV-2 je jednovláknový koronavírus RNA s pozitívnym zmyslom.
Otázka: Čo odštartovalo epidémiu koronavírusu v rokoch 2019-20?
Odpoveď: Tento vírus odštartoval epidémiu koronavírusu 2019-20.
Autor
AlegsaOnline.com SARS-CoV-2 — vírus spôsobujúci COVID-19 Leandro Alegsa
URL: https://sk.alegsaonline.com/art/89225
Zdroje
- time.com : "What's in a Name? Why WHO's Formal Name for the New Coronavirus Disease Matters"
- who.int : "Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV)"
- cdc.gov : "Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China"
- chinacdc.cn : "中国疾病预防控制中心"
- xinhuanet.com : "New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert"
- platform.gisaid.org : "CoV2020"
- who.int : "Pneumonia of unknown cause – China. Disease outbreak news" · web.archive.org
- cidrap.umn.edu : "Report: Thailand's coronavirus patient didn't visit outbreak market" · web.archive.org
- nj.gov : "Update and Interim Guidance on Outbreak of 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV) in Wuhan, China CDC Health Update"
- biorxiv.org : "Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin"
- doi.org : 10.1101/2020.01.22.914952
- ncbi.nlm.nih.gov : CoVZC45
- ncbi.nlm.nih.gov : CoVZXC21

