Klávesy a pedalboard
Najbežnejší organ Hammond má dve klaviatúry, ktoré organisti nazývajú manuály. Sú to menšie verzie klaviatúr klavíra, ktoré sú uložené nad sebou. To umožňuje organistovi hrať na oboch súčasne. Klávesy na manuáloch Hammondových organov sú ľahšie a ľahšie sa stláčajú ako klávesy na klavíri. Vďaka tomu môžu organisti hrať noty rýchlejšie.
Pedálová doska na organe Hammond vyzerá ako veľmi veľká klaviatúra klavíra. Hrá sa na ňu nohami a vydáva veľmi nízko znejúce tóny, známe ako basové tóny.
Na oba manuály a pedálový panel možno hrať súčasne, čo uľahčuje vytváranie zložitých zvukov na organe.
Ťahadlá
Zvuky, ktoré vydávajú manuály a pedalboard, sa ovládajú pomocou prepínačov nazývaných drawbary. Môžete ich vytiahnuť, aby bol zvuk hlasnejší, alebo zatlačiť, aby bol zvuk jemnejší. Každý manuál má deväť ťahadiel, ktoré ovládajú rôzne časti zvuku. Ťahadlá na ľavej strane ovládajú nižšie zvuky, zatiaľ čo ťahadlá na pravej strane ovládajú vyššie zvuky. Pedálový ovládač má dva drawbary a oba ovládajú nízke zvuky.
Perkusie
Orgány Hammond majú funkciu nazvanú "perkusie", ktorá umožňuje pridať do prehrávanej hudby melodické kliknutia. Ovláda sa prepínačmi na ľavej hornej strane organa. Perkusie pridávajú harmonické tóny do melódií, ktoré hráte.
Vibrato a chorus
Na ďalšiu zmenu zvuku organu slúži gombík, ktorý v závislosti od spôsobu otáčania pridáva do hudby vibrato alebo chorus. Vibrato je veľmi malá zmena výšky tónu, ktorá spôsobuje, že noty znejú, akoby sa "kývali". Chorus pridáva k hraným notám ďalšie tóny, aby bol zvuk "plnší".