Naruto Uzumaki
Titulný hrdina, ktorý je členom tímu 7 a Jinchuriki Kurama deväť chvostov, s ambíciou stať sa Hokage, aby si získal rešpekt dedinčanov a všetkých ochránil. V priebehu série sa odhalí, že Naruto je potomkom Asura Otsutsukiho, ktorého čakru a výdrž zdedil, spriatelí sa s mnohými cudzincami a obyvateľmi Konohy a nakoniec získa značný pozitívny vplyv na ich životy až do takej miery, že získa celosvetovú slávu. Narutovi sa nakoniec splní sen stať sa hokagem a založiť si rodinu s Hinatou Hyugou a ich deťmi Borutom a Himawari.
Sasuke Uchiha
Hlavný hrdina série, ktorý je členom tímu 7 a žijúcim členom klanu Uchiha, mocného nindža klanu pochádzajúceho z Indry Otsutsukiho, známeho svojimi očami Sharingan. Sasukeho jedinou túžbou je pomstiť svoj klan, čo ho nakoniec donúti obrátiť sa proti Skrytému listu, keď sa dozvie pravdu až do štvrtej veľkej vojny nindžov. Udalosťami z Boruta prišiel o ruku, Sasuke sa stal potulným strážcom, ktorý vyšetruje vplyv klanu Otsutsuki na svet a zároveň pomáha Konohagakure.
Sakura Haruno
Jedna z Narutových priateliek a členka tímu 7, ktorá po výcviku od Tsunade slúži ako zdravotník skupiny. Sakura bola spočiatku zaľúbená do Sasukeho a zároveň nevraživá k Narutovi, postupne ho vnímala ako priateľa, pričom sa nakoniec vydala za Sasukeho a vychovávala ich dcéru Saradu.
Kakashi Hatake
Vodca a sensei tímu 7/Tímu Kakaši, predtým študent Minata, Narutovho otca, ktorý získal šarigan od svojho tímového kolegu Obita Uchihu. Po štvrtej veľkej vojne nindžov sa Kakaši stal šiestym hokagem a dlhé roky vládol Konohe, než abdikoval v Narutov prospech.
Sai
Nindža, ktorý v druhej časti zaujal Sasukého miesto v Kakashiho tíme a dokázal oživiť jeho kresby. Sai, ktorého dozorca Nadácie Danzo Šimura spočiatku vychovával ako bezcitného drotára, sa začne stávať spoločenskejším, keď si s Narutom a Sakurou porozumejú. V epilógu série sa Sai nakoniec ožení s Jamanakom a po boku svojej ženy Ino vychováva syna Inojina.
Yamato
Člen ANBU, ktorý sa stal sekundárnym vodcom tímu Kakaši, ktorý stratil svoju pôvodnú identitu v dôsledku toho, že Oročimaru na ňom v detstve experimentoval, aby obnovil Haširamov štýl dreva. Vďaka tomu, že vlastnil Haširámove bunky, sa Jamato ukázal ako veľmi dôležitý pri podmanení si Deviatich chvostov vždy, keď sa Naruta chystá pohltiť chvostová zvieracia čakra.
Skrytá listová dedina
Iruka Umino
Inštruktor na nindža akadémii, ktorý v detstve prišiel o rodičov kvôli Kuramovi, čo spôsobilo, že sa cítil trápne, keď sa stal Narutovým učiteľom napriek rozhodnutiu Tretieho hokageho kvôli ich podobnému pôvodu. Iruka je nakoniec prvou osobou, ktorá Naruta uznáva, a stáva sa pre chlapca otcom.
Konohamaru Sarutobi
Vnuk Tretieho Hokageho, ktorý hľadá v Narutovi svojho učiteľa, aby sa stal Hokage, a napodobňuje jeho pracovnú morálku, odhodlanie a charakteristické jutsu, ako sú Rasengan a Sexy jutsu. Konohamaru však trvá na tom, že sa stane Hokagem až po tom, čo sa Naruto stane Hokagem ako prvý. Do udalostí v epilógu série Konohamaru povýšil na hodnosť jonina a stal sa mentorom Narutovho syna Boruta.
Hinata Hyuga
Jeden z Narutových priateľov a člen klanu Hyuga, mocného klanu nindžov pochádzajúceho z rodu Hamura Otsutsuki, ktorý je známy svojimi očami Byakugan. Hoci je Hinata prvorodenou dcérou hlavného rodu, jej plachosť a neschopnosť postaviť sa na vlastné nohy viedli k tomu, že sa jej otec Hiashi zriekol a nahradil ju mladšou sestrou Hanabi. Hinata bola odvtedy zverená do starostlivosti Kurenai Yuhi a stala sa jej žiačkou gennin spolu s Kibou Inuzakom a Šino Abarame ako členka tímu 8. Hinata postupne prejavila city aj k Narutovi, ktorého vlastné odhodlanie ju inšpirovalo k tomu, aby získala sebadôveru, a napokon mu vyznala lásku. Hinata sa za Naruta vydá a do epilógu série majú dve deti.
Tím Asuma
Predtým boli známi ako Tím 10 a tvorili ich syn Tretieho Hokageho Asama Sarutobi a jeho traja študenti Šikamaru Nara, Sakurin rival Ino Jamanaka a Čódži Akimiči. Šikamaru a jeho priatelia sú zároveň súčasnými dedičmi prezývky "Ino-Šika-Čo", pričom ich klany sú blízkymi spojencami. Počas druhej časti je Asuma zabitý členom Akatsuki Hidanom, pričom Šikamaru pomstí svojho mentora, keď sa stane vodcom skupiny. V epilógu série, plniac svoj sľub, že sa postará o Asumovu dcéru Mirai Sarutobi, sa Šikamaru a jeho priatelia každý oženil a vychovávajú svoje deti Šikadai Nara, Chocho Akimichi a Inojin Yamanaka ako ďalšia skupina "Ino-Shika-Cho".
Tímový chlapík
Tím nindžov zložený z Kakashiho rivala Might Guya a jeho troch študentov Rocka Leeho, Hinatinej sesternice Neja Hyugy a Tenten. Sú o rok starší ako ostatní genninovia zo Skrytého listu, pretože Guy chcel počkať rok, kým budú môcť absolvovať skúšku na postup v nindža hodnosti a stať sa chuninom. Na konci série sa Neji obetoval, aby zachránil Naruta a Hinatu, zatiaľ čo ciritálne poškodenie, ktoré Guy prijal do svojho konečného útoku, ho prinútilo odísť do predčasného dôchodku.
Jiraiya
Narutov mentor a jeden z troch legendárnych sanninov, žiakov Tretieho hokageho, ktorí sa neslávne preslávili tým, že v boji prežili Hanzo zo Salamandra skrytého dažďa. Je známy aj ako "Ropušný mudrc", pretože sa naučil mudrcovské jutsu od Cesty z hory Myobu, pričom mu starešina povedal, že jeho študent sa stane záchrancom sveta, a tiež ako "perverzný mudrc" od Naruta, pretože je otvorene chlípnym autorom série najpredávanejších romantických románov pre dospelých. Napísal aj epos "Príbeh odvážneho nindžu", ktorého hlavným hrdinom je Naruto. Počas prvej časti prijal Naruta za svojho študenta, než ho v druhej časti opustil, aby vyšetril Akatsuki a dozvedel sa, že ho vedie jeho bývalý študent Nagato. Jiraiya zomiera v boji, keď posiela správu, aby dal Skrytému listu šancu proti Nagatovi, veriac, že Naruto je dieťaťom proroctva Staršej ropuchy.
Hokage
Pojem Hokage sa vzťahuje na titul vodcu Konohagakure, ktorých bolo v sérii celkovo sedem a ktorých podobizne sú vytesané do skalného útvaru nad Konohagakure.
- Haširáma Sendžu, prvý hokage, bol spoluzakladateľom Konohagakure a bývalým vodcom klanu Sendžu. Haširáma, ktorý v detstve na vlastnej koži zažil obdobie Bojujúcich štátov, chcel konflikt ukončiť a nadviazal priateľstvo s Madarom Učihom skôr, ako ich mladíci vyhlásili za nepriateľov. Haširáma neskôr presvedčil Madaru, aby ich klany uzavreli mier a zároveň našli Konohu. Haširáma neskôr zomrel, pričom ho v priebehu série dvakrát oživil Oročimaru.
- Tobirama Senju, Druhý Hokagem, je Haširamov mladší brat a učiteľ Hiruzena Sarutobiho, ktorý bol považovaný za Hokageho, ktorý vytvoril infraštruktúru Skrytého listu spolu s rôznymi jutsu, medzi ktoré patrí Shadow Clone Jutsu a kontroverzné Reanimation Jutsu, ktorému ho nakoniec podrobil Oročimaru.
- Hiruzen Sarutobi, tretí Hokage, je prvým Hokagem, ktorý sa v sérii predstavil. V celej sérii pôsobí ako zdroj múdrosti pre mladšie generácie a od začiatku je jednou z mála postáv, ktoré sa k Narutovi správajú ako k človeku, a nie ako k jinchuriki. Je tiež mentorom Legendárnych sanninov, pričom ho zabil jeho nepoddajný študent, keď pomocou Smrtiacej pečate uväznil jeho dušu a jeho troch predchodcov do smrťákovho žalúdka spolu s časťou Oročimaruovej duše. Počas Štvrtej veľkej nindža vojny Oročimaru uvoľní Hiruzenovu dušu z Pečate smrti a oživí ho, aby Sasuke mohol potvrdiť udalosti, ktoré stáli za masakrou klanu Uchiha. Neskôr sa zúčastní bitky proti Obitovi a Madarovi spolu s ostatnými vzkriesenými Hokage, než sa po Kaguyinej porážke uloží k odpočinku.
- Minato Namikaze, Štvrtý Hokage, je Narutov otec Uzumaki, ktorý je zároveň Kakashiho učiteľom a Jiraiyovým študentom, ktorý zdokonalil Tobirámovo teleportačné jutsu Lietajúci boh hromu. Pred začiatkom série, po boji s Tobim, Minato odčerpá Kurámovu jinovú čakru, aby oslabil zviera, ktoré má byť zapečatené v Narutovom tele v obetnom akte, aby mal prístup k jangovej čakre Deviatich chvostov iba jeho syn. Minato, ktorého po rokoch oživil Oročimaru ako Jinchurikiho Deviatich chvostov, sa znovu stretol s Narutom a nakoniec preniesol jinovú čakru Deviatich chvostov na svojho syna, než sa vrátil do posmrtného života.
- Tsunade, piata Hokage, je Hokage po väčšinu série, je podobou tretej Hokage a členkou klanu Senju prostredníctvom svojho starého otca Hashirama, ktorá má nadľudskú silu a používa techniku premeny, aby si zachovala svoj mladistvý vzhľad. Tsunade pôvodne nechcela mať nič spoločné s Hokage, pretože jej mladší brat Nawaki a jej priateľ Dan Kato zomreli pri plnení tohto sna. Po stretnutí s Narutom Uzumakim však znovu nadobudne vieru a stane sa Hokage, pričom svoje schopnosti odovzdá Sakure a Ino. Na konci série Tsunade na konci štvrtej veľkej nindža vojny odchádza do dôchodku a titul Hokage udeľuje Kakašimu.
Danzo Shimura
Obyvateľ Skrytého listu, ktorý je vodcom Nadácie, tajnej organizácie tajne dohliadajúcej na bezpečnosť ich dediny, pričom jeho osobným cieľom je stať sa Hokage. Keďže Hiruzena a jeho nástupcov považoval za slabochov, Danzove činy spôsobili množstvo udalostí, medzi ktoré patrí masaker Uchiha, privolanie Orochimarua, ktorý mu transplantoval pravú ruku s viacerými očami Sharinganu a Haširamove bunky. Hoci Danza počas Tsunadinej kómy vymenovali za úradujúceho kandidáta na šiesteho hokageho, nakoniec ho smrteľne zranil Sasuke, pričom jeho smrť viedla k rozpusteniu Nadácie po Štvrtej veľkej nindža vojne.
Antagonisti
Zabuza Momochi
Jeden z Narutových prvých protivníkov a bývalý člen Siedmich šermiarov zo Skrytej hmly, skupiny nindžov, ktorí v boji používajú mimoriadne veľké meče. Zabuza, neslávne známy tým, že v rámci absolventského rituálu vyvraždil celú svoju triedu, vlastní veľký meč s názvom Katova čepeľ, ktorý sa dokáže sám opravovať absorbovaním železa z krvi. Zabuza a jeho učeň Haku, majiteľ ľadového štýlu Kekkei Genkai, skončia ako zbehlí nindžovia po neúspešnom štátnom prevrate štvrtého Mizukageho a stanú sa nájomnými zabijakmi, aby financovali ďalší pokus pod vedením zločineckého bossa menom Gato. Stretnutie s tímom 7 a zrada zo strany Gata však vyústili do Zabuzovej smrti, keď ho spolu s Hakuom oživil Kabuto počas Štvrtej veľkej vojny nindžov.
Orochimaru
Zločinec, ktorý slúžil ako hlavný zloduch v prvej časti, Hiruzenov svojrázny študent, ktorý sa predtým pridal k Akatsuki a spojil sa s Danzom. Oročimaruova túžba po nesmrteľnosti, aby sa mohol naučiť všetky existujúce justu, ho priviedla k experimentovaniu na svojich kolegoch nindžoch predtým, ako si založil vlastnú nindža dedinu, Skrytú zvukovú dedinu, ktorá slúžila ako jeho osobné laboratórium na pokračovanie v práci a zároveň na zhromažďovanie osobnej armády, s ktorou chcel zničiť Konohu. Jeho technika nesmrteľnosti spočíva v tom, že každých niekoľko rokov prenáša svoje vedomie medzi rôznymi hostiteľskými telami, pričom jeho zámer získať telo Sasukeho Uchihu bol jeho hlavnou motiváciou počas väčšiny série. Po skončení druhej časti, vďaka tomu, že ho Yamato držal pod dohľadom, sa Orochimaru zriekol svojej osobnej vojny proti dedine Skrytých listov a zároveň vytvoril Mitsuki.
Kabuto Yakushi
Oročimaruova pravá ruka a špión, ktorý je dostatočne zdatný v lekárskom ninjutsu, aby mohol manipulovať s bunkami. Kabuto bol pôvodne infiltrátorom Nadácie, ktorý si nepamätal svoju minulosť a ktorého Oročimaru prijal, keď ho Danzo považoval za bezpečnostné riziko, Kabuto využíva svoje schopnosti na zhromažďovanie informácií o rôznych skupinách v Oročimarovom mene. Po tom, čo bol Oročimaru potlačený, sa Kabuto rozhodne stať sa pánom svojho osudu tým, že ovládne jutsu Hadí mudrc, pričom do svojho tela integruje časť Oročimaruových pozostatkov spolu so vzorkami DNA Zvukovej päťky, Jugo, Suigetsu a Karin. Kabuto tiež zdokonalí Reanimation jutsu a vynúti si spojenectvo s Tobim so Sasukem ako odmenu za jeho povrchy. Kabuto však nakoniec skončí porazený a prehodnotí svoje životné rozhodnutia, keď sa rozhodne zachrániť Sasukeho. Po skončení vojny, držaný pod dohľadom Skrytého listu, sa Kabuto vrátil viesť sirotinec, v ktorom bol držaný ako dieťa spolu so svojím adoptívnym bratom Urushi.
Itachi Uchiha
Zbehlý nindža zo Skrytého listu, ktorý sa po vyvraždení svojho klanu pridal k Akatsuki a bol vykreslený ako zloduch. Po smrti sa však ukázalo, že Itači bol lojálny Skrytým listom a svoju rodinu zabil len preto, že sa mu vyhrážali pokusom o štátny prevrat na príkaz Danza, ktorému pomáhal Tobi. Itači prijme úlohu pod podmienkou, že Sasukeho ušetrí, pretože plánoval, že ho Sasuke zabije. Itachi si zachováva lojalitu k Skrytému listu tým, že tajne špehuje Akatsuki, pričom je partnerom Kisameho, kým je jeho členom.
Akatsuki
Hlavnú antagonistickú silu druhého dielu série Naruto založili Jiraiyovi študenti Yahiko, Nagato a Konan ako mierovú skupinu v Skrytom daždi, než tragédia zinscenovaná Danzom umožnila Tobimu premenovať ju na nájomných žoldnierov zložených z darebáckych nindžov. Akatsuki, s Nagatom teraz ako hlavným vodcom, ktorý predpokladá, že ich cieľom je prinútiť všetkých, aby pochopili utrpenie v záujme skutočného mieru, koná podľa Madarovho projektu Tsuki no Me (Mesačné oko), aby nakŕmili chvostnaté beštie sochou Gedo a vrhli Nekonečné Tsukiyomi, aby si podrobili celé ľudstvo.
- Nagato, známy predovšetkým pod prezývkou Bolesť s Madarovými očami, ktoré mu boli implantované v detstve, je vodcom Akatsuki a partnerom Konana. "Pain", ktorý sa v seriáli najčastejšie objavuje a používa, je Deva Path, čo je v skutočnosti mŕtvola Nagatovho zosnulého priateľa Yahika, ktorý bol zakladajúcim vodcom Akatsuki, pričom oni a Konan boli vojnové siroty, ktoré sa naučili ninjutsu od Jiraiya. Po tom, čo bol po Yahikovej smrti zmrzačený, Nagato používa šesť upravených tiel známych ako Šesť ciest bolesti ako zástupcov, z ktorých každý využíva šestinu jeho plnej sily. Po zabití Jiraiyu viedol Nagato útok na Skrytý list, pričom Naruto porazil jeho Cesty a podarilo sa mu obnoviť Nagatovu vieru v Jiraiyovo učenie, keď sa obetoval, aby použil jutsu Tobi určené na vzkriesenie Madaru. Tobi neskôr znesvätí miesto Nagatovho odpočinku, aby získal Rinnegan, ktorý Madara neskôr získa späť, pričom Kabuto oživí Nagata pre Štvrtú veľkú vojnu nindžov, než ho Itači zapečatí.
- Konan, jediná členka skupiny Akatski a Nagatova priateľka z detstva. Počas pôsobenia pod vedením Jiraiya sa Konan naučila využívať svoj prirodzený talent na origami, ktorý využívala ako kľúčový prvok svojho bojového štýlu. Po Nagatovej smrti sa Konan stiahne z Akatsuki a neskôr bojuje s Tobim, keď si príde po Rinneganove oči, a nakoniec zahynie po tom, čo jej samovražedný útok zlyhal.
- Kisame Hoshigaki, darebácky ninja z dediny Hidden Mist, ktorý je partnerom Itachiho Uchihu. Ako jeden zo siedmich šermiarov z Mlhy používa živý šupinový meč s názvom Žraločia koža, ktorý absorbuje nevýslovné množstvo súperovej čakry a prenáša ju do Kisameho, aby mu dodal nekonečné množstvo výdrže. Dôvodom jeho vstupu do Akatsuki bolo vidieť svet bez lží, neskôr sa vydal za Killer Bee, kým sa jeho misia nezmenila na infiltráciu, než po zajatí spáchal samovraždu a zároveň poslal Tobimu polohu jinchuriki.
- Sasori, lúpežný nindža zo skrytého piesku, známy ako "Sasori z červeného piesku" vďaka svojmu talentu na výrobu jedov. Sasoriho vychovala jeho babička Chiyo po tom, čo jeho rodičov zabil Kakashiho otec Sakumo Hatake, a jeho posadnutosť výrobou vecí, ktoré pretrvajú večne, mu umožnila vyvinúť prostriedok na premenu ľudských tiel na bábky, ktorých schopnosti za života môže využívať. Sasori opustil svoju dedinu, uniesol Tretieho Kazekageho a urobil z neho svoju hlavnú zbraň po tom, čo jeho železný piesok obohatil jedom. Sasori neskôr premenil svoje vlastné telo na bábku, ktorá sa ukrýva v jeho obrnenom tele bábky Hiruko, čím sa stáva v podstate smrteľníkom a zároveň ovláda stovky bábok naraz. Po tom, čo sa pridal k Akatsuki, sa Sasori spojil s Orochimarom a potom s Deidarom, keď zajali Gaaru, aby z neho mohli získať Jeden chvost. Sasori však nakoniec zahynie a jeho telo bábky použije Kankuro.
- Deidara, nindža zo Skrytého kameňa, ktorý sa živil ako nájomný terorista s hlinenými výbušninami, kým ho Itači Učiha donútil pridať sa k Akatsuki. Hoci si organizáciu obľúbil, stal sa partnerom Sasoriho a potom Tobiho, Deidara si vypestoval zášť voči klanu Uchiha vo všeobecnosti, pretože cíti, že ich oči Sharinganu sa pozerajú na jeho dielo. Po tom, čo zohral úlohu pri Gaarovom zajatí a pri zajatí Troch chvostov, Deidara bojuje so Sasukem a nakoniec sa vyhodí do vzduchu v poslednom pokuse zabiť svojho protivníka. Deidara je neskôr oživený Kabutom počas Štvrtej veľkej vojny nindžov predtým, ako ho porazí Kankuro.
- Hidan, sadomasochistický nindža zo skrytej dediny Vriacej vody, ktorý je ozbrojený kosou a je partnerom Kakuzu. Ako člen kultu smrti známeho ako Cesta Jašin sa Hidan stal nesmrteľným a zároveň vyvinul rituálne techniky, ktoré mu umožňujú zavraždiť protivníka spôsobením smrteľných zranení. Hidan sa po zavraždení Asamu stal nepriateľom Šikamarua, skončil rozštvrtený a pochovaný v rodinnom lese Nara.
- Kakuzu, nindža z dediny Skrytý vodopád a Hidanov partner. Kakuzu, ktorý žil za čias Prvého Hokageho, ovládal zakázané jutsu, ktoré spôsobuje, že jeho telo drží pohromade čierne hrozby a asimiluje až päť sŕdc, aby si predĺžil život na neurčito. Kým ho chamtivosť prinútila slúžiť ako pokladník Akatsuki a lovec odmien, zabil väčšinu svojich partnerov, kým sa spojil s nesmrteľným Hidanom. Kakuzuove srdcia sú systematicky ničené počas jeho boja proti nindžom zo Skrytých listov, pričom Kakashi ho dorazí po tom, čo Naruto nechá svoje posledné srdce na pokraji zlyhania. Kakuzu je neskôr oživený počas Štvrtej veľkej vojny nindžov, než je zapečatený.
Obito Uchiha
Tiež známy Tobi, on je skutočný vodca Akatsuki je primárny antagonista pre väčšinu časti II. Podobne ako Naruto v detstve počas Tretej veľkej vojny nindžov daroval svoje ľavé oko svojmu tímovému kolegovi Kakašimu, keď sa zdalo, že zomrie. Napriek jeho zdanlivej smrti Obita zachránil Madara, ktorý mu poškodené časti tela nahradil protézami Zetsu a zároveň ho pripravil na to, aby sa stal jeho učňom, pričom nindža zariadil, aby sa Obito stal svedkom smrti Rin Nohara ako vojnovej obete, ktorú mal neochotný Kakashi zlomiť na duchu. Keď Obito dospeje k záveru, že môže použiť Chvostnaté beštie na zničenie súčasnej reality a vytvorenie utópie, prijme Madarovo meno a zo zloby voči svojmu bývalému mentorovi Minatovi zmanipuluje udalosti, ktoré umožnia vznik súčasného z Akatsuki a útok Deviatich chvostnatých beštie na dedinu Skrytý odchod. Okrem toho, že Obito dokáže používať svoj pravý Sharingan na manipuláciu s Kamuiom spôsobom, vďaka ktorému sa zdá, že je nehmotný, a teleportovať sa na veľké vzdialenosti, dokáže používať útoky v štýle dreva, pretože jeho protézy ovládajú Haširámove bunky. Po porážke a obnovení svojej viery vo svet a znovuzískaní sharinganu, ktorý dal Kakašimu, Obito zomiera pri ochrane tímu 7 pred Kaguyou a zostáva medzi živými dosť dlho na to, aby v duchu pomohol Kakašimu.
Madara Uchiha
Jeden zo spoluzakladateľov dediny Skrytých listov spolu so svojím priateľom z detstva a úhlavným nepriateľom Haširámom Sendžúom, ktorí sa neskôr ukázali ako reinkarnácie zakladajúcich predkov svojich klanov Indru a Asuru pred Sasukem a Narutom. Madara je pomstychtivý a arogantný cynik, ktorý Senjuovi zazlieval zabitie svojich bratov počas obdobia Bojujúcich štátov, nakoniec prijal Haširámovu ponuku na mier a napokon sa v ňom sklamal, pretože si uvedomil, že v dedine Skrytých listov nemá miesto. To ovplyvnilo Madaru, aby sa pokúsil zničiť Skrytý list pomocou Deviatich chvostov, než ho Haširáma porazil, predstieral svoju smrť a použil Haširámovu krv na prebudenie svojho Rinneganu a vyvolanie sochy Gedo, aby si predĺžil život. Madara nakoniec zomiera po tom, čo sa jeho agentom stal Obito Uchiha, ktorý svoj Rinnegan transplantoval do Nagata, aby sa zachoval pre jeho plánované vzkriesenie. Napriek niekoľkým neúspechom sa Madara vzkriesi a vytvorí zo seba desať chvostov jinchuriki, aby uskutočnil svoj plán, než ho zradí Čierny Zetsu a urobí z neho nádobu pre Kaguyu. Hoci sa po opätovnom zapečatení Kaguye oslobodil, táto skúška priviedla ľutujúceho Madaru na pokraj smrti a nakoniec zomiera, keď sa zmieril s Haširámom.
Kaguya Otsutsuki
Ústredný základný antagonista série Naruto a člen hlavnej rodiny klanu Otsutsuki, rasy cudzích nindžov, medzi ktorých potomkovia patria Senju, Uchiha a Hyuga. Keďže sa Kaguya rozhodla chrániť svet, a nie sa ním živiť ako jej príbuzní, stáva sa predĺženou rukou Božského stromu sveta, keď nastolila svoj ideál svetového mieru. Kaguya však nakoniec stratí dôveru v ľudstvo, keď premení niektorých ľudí asimilovaných Božským stromom na svoju osobnú armádu Bieleho zetsu ako obranu proti svojim príbuzným, čo vedie ku konfrontácii s jej poloľudskými synmi-dvojčatami Hagoromom a Hamurom, keď sa dozvedia, že zdedili jej čakru. Kaguya nakoniec splynula s Božským stromom a premenila ho na Desať chvostov, než ju Hagoromo zapečatil na Mesiaci a zmenšil na mŕtvolnú sochu Gedo, zatiaľ čo jej získaná čakra sa rozštiepila na deväť chvostových zvierat. Kaguya však v poslednej sekunde vytvorila Čierneho Zetsu, aby prostredníctvom Indru a klanu Uchiha zorganizovala svoj návrat, pričom Madara Uchiha sa nakoniec stal jej nádobou, keď raz poslúžil jej účelu. Narutovi a Sasukemu sa však s pomocou ich tímu podarí Kaguyu s Chvostnatými šelmami a Madarom vyextrahovať z jej tela.
- Zetsu, jediný neľudský člen Akatsuki, ktorý slúži ako ich špión a je poverený likvidáciou zosnulých členov Akatsuki alebo tých, ktorých organizácia nechce nájsť. Zetsu sa v skutočnosti skladá z dvoch bytostí, pričom prvou je tieňový symbiont známy ako Čierny Zetsu, ktorého vytvorila Kaguya, aby manipuloval s jej vnukom Indrom a jeho potomkami predtým, ako Madara zhmotnil Rinnegan, ktorý mal slúžiť ako prostriedok na oslobodenie Kaguye. Čierny Zetsu predstieral Madarov konštrukt, zatiaľ čo bol spojený s Bielym Zetsu, jedným z tisícov bývalých ľudí, ktorí boli asimilovaní v rámci sochy Gedo ako rastlinní dronoví vojaci. Po tom, čo Bieleho Zetsua zabije Sasuke počas Štvrtej veľkej vojny nindžov, Čierny Zetsu sa nakoniec prilepí na Obita a potom na Madaru, než ho zapečatia spolu s Kaguyou.
- Tobi, známy aj ako "Gurguru", je biely Zetsu, ktorý slúžil ako Obitov exoskelet počas vyrovnávania sa s jeho novým telom a slúžil ako inšpirácia pre Obitovu podobu Tobiho. Tobi sa zúčastňuje na Štvrtej veľkej vojne nindžov tým, že obklopí Yamata, aby získal prístup k jeho Drevenému štýlu, a potom ho katapultuje, keď sa Madarovi podarí vrhnúť Nekonečné Tsukiyomi, naposledy je videný, ako sa rozpadá po zrušení jutsu, pričom jeho bývalý zajatec je jediným svedkom jeho smrti.
