Raná história (1502-1658)
Ostrov objavil v roku 1502 portugalský admirál João da Nova a pomenoval ho Santa Helena podľa Heleny Konštantínopolskej. Za tradičný dátum tohto objavu sa dlho považoval 21. máj, ale výsledky vyšetrovania objavu zverejnené v roku 2015 dospeli k záveru, že tento dátum je pravdepodobne nesprávny, 3. máj sa zdá byť historicky platnejší. Iná teória tvrdí, že ostrov, ktorý našiel De Nova, bol v skutočnosti Tristan da Cunha, vzdialený 2 430 km južne, a že Svätú Helenu objavila 30. júla 1503 niektorá z lodí pod velením Estêvão da Gama.
Portugalci našli ostrov neobývaný, s množstvom stromov a sladkej vody. Doviezli sem dobytok, ovocné stromy a zeleninu a postavili kaplnku a jeden alebo dva domy. Hoci tu nevytvorili žiadnu stálu osadu, ostrov bol pre lode, ktoré cestovali z Ázie do Európy, dôležitým miestom na zastávku, kde sa mohli zásobiť potravinami a vodou, a často sa tu nechávali chorí námorníci, aby sa zotavili. Po roku 1588 ostrov navštevovali aj holandské a anglické lode.
Holandská republika si v roku 1633 oficiálne nárokovala Svätú Helenu, hoci neexistujú žiadne dôkazy o tom, že by ju niekedy obsadila, kolonizovala alebo opevnila. Do roku 1651 Holanďania ostrov zväčša opustili v prospech svojej kolónie na myse Dobrej nádeje.
Východoindická spoločnosť (1658-1815)
V roku 1657 dostala anglická Východoindická spoločnosť od Olivera Cromwella povolenie spravovať ostrov Svätá Helena a v nasledujúcom roku sa spoločnosť rozhodla kolonizovať ostrov farmármi. Prvý guvernér, kapitán John Dutton, sa tam dostal v roku 1659 a urobil zo Svätej Heleny jednu z najstarších britských kolónií mimo Severnej Ameriky a Karibiku. Bola dokončená pevnosť a postavených niekoľko domov. Po obnovení anglickej monarchie v roku 1660 dostala Východoindická spoločnosť kráľovské povolenie založiť na ostrove kolóniu. Pevnosť bola pomenovaná James Fort a mesto Jamestown na počesť vojvodu z Yorku, neskoršieho anglického kráľa Jakuba II.
Dovoz otrokov bol v roku 1792 zakázaný a na farmy sa začali dovážať čínski robotníci. Mnohí z nich mohli zostať a ich potomkovia sa integrovali do obyvateľstva.
Britská vláda (1815-1821) a Napoleonov exil
V roku 1815 sa britská vláda rozhodla využiť ostrov Svätá Helena ako miesto zadržiavania Napoleona Bonaparta. Aby zabránila akémukoľvek pokusu o útek z okolitých ostrovov, formálne anektovala ostrovy Ascension a Tristan da Cunha. V roku 1821 Napoleon na ostrove Svätá Helena zomrel.
V roku 1858 získal francúzsky cisár Napoleon III. v mene francúzskej vlády do vlastníctva Longwood House a pozemky okolo neho, posledné sídlo Napoleona I. (ktorý tu zomrel v roku 1821). Stále je to francúzsky majetok.
Koruna kolónia (1834-1981)
22. apríla 1834 sa ostrov Svätá Helena stal kolóniou britskej koruny.
Miestny priemysel využívajúci vlákna z novozélandského ľanu bol úspešne obnovený v roku 1907 a počas prvej svetovej vojny prinášal značné príjmy. Tento priemysel však upadal kvôli nákladom na dopravu a konkurencii syntetických vlákien a posledný ľanový priemysel bol zatvorený v roku 1965.
V roku 1922, Ascension potom bol pripojený ako závislý nasledovaný Tristan da Cunha Island 12 Januára 1938.
1981 až súčasnosť
V roku 1981 britská vláda zmenila štatút Svätej Heleny a ostatných korunných kolónií na "britské závislé územia".
V roku 2009 získali Svätá Helena a jej dve územia rovnaký štatút podľa novej ústavy a britské zámorské územie bolo premenované na Svätú Helenu, Ascension a Tristan da Cunha.