Hermann Emil Fischer (9. októbra 1852 - 15. júla 1919) bol nemecký chemik, ktorý v roku 1902 získal Nobelovu cenu za chémiu.

Fischer bol zakladateľom chémie primárnych prírodných produktov: sacharidov, purínov a nukleozidov, peptidov a proteínov. Medzi jeho mnohé objavy patrí štruktúra sacharidov a ako prvý získal syntetické peptidy. Skúmal účinné látky čaju, kávy a kakaa, konkrétne kofeín a teobromín.

Fischer tiež navrhol model enzýmového pôsobenia "lock & key".