Zooxanthellae
Niektoré dinoflageláty sú zooxantely: endosymbionti morských eukaryotov a živočíchov, ako sú napríklad antozoické koraly. Tieto koraly budujúce útesy sú od nich do veľkej miery závislé. Medzi ďalšie organizmy, ktoré môžu byť hostiteľmi zooxantel, patria medúzy, lastúrniky, foraminifery, morské slimáky, t. j. nudibranche, a tiež ciliáty a radiolárie.
Červené prílivy
Dinoflageláty sú zodpovedné za "červený príliv", ktorý môže otráviť ryby. Niekedy kvitnú v koncentrácii viac ako milión buniek na mililiter. Niektoré druhy produkujú neurotoxíny, ktoré v takomto množstve usmrcujú ryby a hromadia sa vo filtrátoroch, ako sú mäkkýše, ktoré ich následne môžu preniesť na ľudí, ktorí ich konzumujú. Tento jav sa nazýva červený príliv podľa farby, ktorú kvitnúca voda získava. Nie všetky kvety dinoflagelátov sú nebezpečné. Modrasté záblesky viditeľné v noci v oceánskej vode často pochádzajú z kvitnutia bioluminiscenčných dinoflagelátov, ktoré pri narušení vydávajú krátke svetelné záblesky.
Klasifikácia
Aj keď sú klasifikované ako eukaryoty, jadrá dinoflagelát nemajú niektoré kľúčové vlastnosti eukaryotických jadier. Dodge v skutočnosti označil dinoflagelátové jadro ako mezokaryotické, a to z dôvodu, že má medzistupeň medzi stočenými oblasťami DNA prokaryotických baktérií a dobre definovaným eukaryotickým jadrom. Táto skupina však obsahuje typicky eukaryotické organely, ako sú Golgiho komplexy, mitochondrie a chloroplasty.
Táto skupina obsahuje mnoho zložitých organel a životných štýlov. Niektoré majú štruktúry podobné skôr očiam stavovcov, niektoré majú nematocysty, niektoré žijú ako plazmódie (viacjadrové formy), niektoré majú dva bičíky, fotosyntetizujúce dinoflageláty obsahujú "ohromujúcu škálu" typov plastidov a celá ich genetika a bunková biológia je excentrická.
Skameneliny
Fosílne dinoflageláty sú dôležité pre stratigrafiu, datovanie a koreláciu vrstiev. Počas svojho života majú dinoflageláty pohyblivú planktonickú formu a odolnú cystickú fázu, ktorá im umožňuje prežiť zimu v sedimentoch. Fosíliou je len cysta. Ich prvý istý výskyt je v období silúru, s veľkou radiáciou v období mezozoika. s. 440 Margulis a kol. ich zaradili do fyziologického útvaru Dinomastigota.
