Endokrinný systém zahŕňa tie telesné orgány, ktoré produkujú hormóny. Pomáha regulovať metabolizmus, rast a vývoj, funkciu tkanív a podieľa sa aj na nálade. Oblasť medicíny, ktorá sa zaoberá poruchami žliaz s vnútorným vylučovaním, je endokrinológia.

Endokrinný systém je vo fyziológii sústava žliaz, z ktorých každá vylučuje určitý typ hormónov priamo do krvného obehu, aby regulovala činnosť organizmu.

Endokrinný systém je na rozdiel od exokrinného systému, ktorý vylučuje chemické látky pomocou kanálikov. Endokrinný systém je informačný signálny systém ako nervový systém, jeho účinky a mechanizmus sú však odlišné.

Účinky endokrinného systému začínajú pomaly a ich odozva je dlhodobá. Nervový systém vysiela informácie rýchlo a reakcie sú spravidla krátkodobé. Hormóny sú zložité chemické látky uvoľňované z endokrinného tkaniva do krvného obehu, odkiaľ putujú do cieľových tkanív a vyvolávajú reakciu.

Endokrinné žľazy sa vo všeobecnosti vyznačujú tým, že nemajú kanáliky, sú dobre prekrvené a zvyčajne majú vo vnútri buniek vakuoly alebo granule, v ktorých sa ukladajú hormóny.