Prvá bitka pri Kernstowne
Bitka sa odohrala 23. marca 1862 v okrese Frederick a Winchester vo Virgínii. Bola to úvodná bitka Jacksonovej kampane v údolí. Jacksonov veliteľ kavalérie, plukovník Turner Ashby, sa 22. marca 1862 stretol s jednotkami Únie. Dňa 23. marca Jackson poslal svoju kavalériu pod Ashbyho vedením proti pozíciám Únie. Plukovník Nathan Kimball, veliteľ Únie, sústredil svoje sily na Pritchard Hill a rozmiestnil tam aj svoje delostrelectvo. Jackson rozmiestnil svoje delostrelectvo západne od Pritchard Hill na Sandy Ridge. Počas bitky navštívil svoje delostrelecké postavenie. Zistil, že hoci si myslel, že útočí na stredne veľkú armádu Únie, v skutočnosti bojoval proti celej divízii. Keď Jackson videl, že jeho sila je oveľa väčšia, obrátil sa k svojmu pobočníkovi a povedal: "Máme to za sebou."
Jackson zmenil svoj plán útoku. Umiestnil svoju pechotu okolo diel na Sandy Ridge. Kimball, ktorý si neuvedomoval, že jeho sily prevyšujú Jacksonove, zaútočil na Sandy Ridge, aby umlčal konfederačné delá. Približne o štvrtej hodine Kimballova pechota narazila na Jacksonovu Stonewallovu brigádu na úpätí Sandy Ridge, pričom došlo k ťažkým bojom. Jacksonovi sa podarilo udržať svoje pozície len napriek tomu, že neustále posielal ďalšie jednotky. Boj sa čoskoro zmenil na patovú situáciu, keď ani jedna strana nebola schopná zatlačiť tú druhú. Kimball začal posielať posily Únie a o šiestej hodine už konfederátom dochádzala munícia. Vtedy sa začali sťahovať. Čoskoro sa ústup zmenil na prebiehajúci boj, ktorý sa skončil až po zotmení.
Hoci bitka znamenala pre Konfederáciu taktickú porážku, pre Juh predstavovala strategické víťazstvo. Zabránila Únii vyslať sily z údolia Shenandoah, aby posilnili McClellana na polostrove.
Bitka o McDowell
Po bitke pri Kernstowne sa Jackson stiahol na juh k Swift Run Gap. Jeho armáda sa spojila so Severozápadnou armádou Edwarda Johnsona. Pridala sa k nim aj divízia pod velením Richarda S. Ewella. Jackson mal teraz približne 17 000 vojakov Konfederácie.
Johnsonova Severozápadná armáda bola veľká asi ako brigáda. V čase, keď sa pripojil k Jacksonovi, nasledovala jeho armádu brigáda Únie, ktorej velil generál Robert H. Milroy. Milroy očakával podporu ďalšej brigády Únie pod velením generála Roberta C. Schencka. Milroy sa presunul na západ neďaleko dediny McDowell a čakal na Milroya. Jackson, ktorý bol teraz v Stauntone vo Virgínii, postupoval so svojimi silami na západ smerom k Milroyovej a Scheneckovej brigáde Únie. Milroy 8. mája zaútočil na konfederátov na Sitlingtonovom vrchu. Obe armády bojovali štyri hodiny a nakoniec za súmraku vrhli Milroyovu armádu späť. Zatiaľ čo konfederáti utrpeli väčšie straty, Milroy a Schenck v noci ustúpili do západnej Virgínie. Jacksonovi tak zostala voľná cesta, aby mohol zatlačiť na druhú armádu Únie v údolí. Sily Únie by v údolí zamestnal na ďalší mesiac.
Bitka pri Front Royal
Ďalšia bitka sa odohrala 23. mája 1862 pri Front Royal vo Virgínii. Jacksonove sily zaútočili na posádku Únie s 1 000 mužmi, ktorej velil plukovník Kenly. Konfederanti prekvapili pikenýrov a rýchlo ich prepadli. Zahnali sily Únie späť cez ulice Front Royal na Camp Hill (dnes Overlook Park v juhovýchodnej časti Winchestru). Kenlyho jednotky sa pri ústupe pokúsili podpáliť riečne mosty, ale požiare boli rýchlo uhasené. Na kopci Camp Hill sa sily Únie postavili na odpor, než sa stiahli na Guard Hill. Konfederačné sily ich rýchlo obkľúčili a ustúpili smerom na Cedarville. Konfederačná kavaléria pod velením majora Flournoya podnikla dva útoky na ustupujúce sily Únie. Asi 900 vojakov Únie sa vzdalo.
Prvá bitka pri Winchesteri
Jacksonovo víťazstvo pri Front Royal prinútilo generála Únie Nathaniela Banksa presunúť svoje sily zo Strasburgu a ustúpiť do Winchesteru. Keďže Jackson bol teraz na jeho pravom krídle, Banksovi hrozilo, že bude odrezaný od svojej základne vo Winchesteri. Prezident Lincoln mal pocit, že Jacksonova armáda v údolí Shenandoah ohrozuje bezpečnosť Washingtonu D.C. Nariadil zboru generála Irvina McDowella, aby udržal svoje pozície pri Fredericksburgu vo Virgínii a nepripojil sa k McClellanovmu úniovému ťaženiu na Richmond.
Keď Banks dorazil do Winchesteru, začal organizovať svoju obranu. Jacksonova armáda sa blížila z juhu, zatiaľ čo Ewellova armáda z juhovýchodu. Dňa 25. mája Jacksonove sily podnikli prvý útok, ale boli odrazené. Ewellova divízia zaútočila na Camp Hill. V tom istom čase Jacksonova louisianská brigáda obkľúčila a potom obsadila pozície Únie na Bowerovom vrchu (juhozápadná časť Winchestru). S prelomenými bokmi začali jednotky Únie dezorganizovane ustupovať cez mesto Winchester. Na vojakov Únie strieľali aj obyvatelia Winchestru. Banks ustúpil cez rieku Potomac späť do Marylandu. V dôsledku bitky Banks stratil približne 2 000 mužov a takmer všetky zásoby. Celkové straty Konfederácie predstavovali len asi 400 osôb. Toto bolo rozhodujúce víťazstvo Jacksonovej kampane v údolí.
Bitka pri Cross Keys
Lincoln sa teraz obával, že ak Banks nezadrží Jacksona, jeho konfederačná armáda by mohla zaútočiť na Washington D.C. 24. mája nariadil generálom Johnovi C. Frémontovi a Irvinovi McDowellovi, aby vyslali jednotky na podporu Banksa. Bolo to ešte predtým, ako bol Banks porazený pri Winchestri. Frémont dostal rozkaz presunúť svoje sily smerom na juhovýchod k Harrisonburguvo Virgínii. McDowell dostal rozkaz vyslať 20 000 zo svojich 40 000 vojakov na podporu Banksa pri Winchestri.
8. júna Frémontova armáda Únie s 11 500 vojakmi našla Ewellovu konfederačnú divíziu pri Cross Keys vo Virgínii. Ewell dostal rozkaz blokovať Frémontov pohyb smerom k Port Republic vo Virgínii. Bitka sa začala dvojhodinovým súbojom medzi delostrelectvom Únie a Konfederácie. Flankovací manéver Únie z ľavej strany bol odrazený salvou konfederačnej paľby. Prekvapujúca salva si za necelých desať minút vyžiadala 258 obetí z radov Únie. Frémont si neuvedomil, že má do činenia s menšími silami Konfederácie. Pod ochranou svojich delostreleckých batérií sa Frémont stiahol na Keezletown Road. Nasledujúci deň, zatiaľ čo dve brigády Konfederácie zadržiavali Frémonta tam, kde bol, zvyšok Ewellových konfederátov sa presunul k Port Republic.
Bitka o prístavnú republiku
9. júna 1862 sa v Port Republic vo Virgínii odohrala posledná zo šiestich bitiek Jacksonovej kampane v údolí. Jackson dorazil do tejto oblasti 7. júna po zotmení. Na druhý deň sa dozvedel, že Frémontovým jednotkám Únie bolo zabránené, aby sa spojili s jednotkami generála Jamesa Shieldsa pri Cross Keys. Skoro ráno 9. júna Jacksonove sily použili provizórny most na prechod cez South River vo Virgínii. Generál Únie Erastus B. Tyler umiestnil delostrelecké batérie na hrebeni, ktorý kryl prednú časť pozícií Únie. Keď Jackson dorazil, nariadil útok cez pšeničné pole bez toho, aby venoval čas organizácii svojich síl. Nevykonal ani prieskum, aby zistil, aké sily Únie sa tam nachádzajú a ako sú rozmiestnené. Útok Konfederácie viedla Stonewallova brigáda. Keď postupovali vpred, dostali sa pod silný útok Tylerových delostreleckých batérií. Jackson poslal louisianskú brigádu Richarda Taylora na útok z boku proti delostrelectvu Únie. Delostrelci Únie si však všimli, že sa rozvíja útok z boku, a konfederátov pritlačili k zemi delostreleckou paľbou. Jackson vedel, že musí preraziť líniu Únie skôr, ako sa Frémont pripojí k Shieldsovi. Zatiaľ čo sa Jackson snažil nájsť spôsob, ako problém vyriešiť, Ewellovi muži dorazili od Cross Keys. Ewell okamžite videl problém a zaútočil na ľavé krídlo Únie. To poskytlo Stonewallovej brigáde čas na preskupenie. Konfederačné delostrelecké batérie otvorili front Únie. To spôsobilo, že línia Únie sa zlomila a ustúpila na ústup. Týmto posledným víťazstvom získal Jackson kontrolu nad horným a stredným údolím Shenandoah.
