Inkubačná doba je čas, ktorý uplynie odo dňa, keď sa osoba infikuje patogénom (niečím, čo spôsobuje chorobu, napríklad vírusom), do dňa, keď sa u nej začnú prejavovať príznaky choroby. Ak je napríklad osoba infikovaná bežným prechladnutím, zvyčajne trvá približne jeden až tri dni, kým sa u nej začnú prejavovať príznaky prechladnutia. To znamená, že inkubačná doba prechladnutia je jeden až tri dni.
Pri niektorých ochoreniach, ako je napríklad vírus ľudskej imunitnej nedostatočnosti (HIV, vírus spôsobujúci AIDS), môže človek ešte počas inkubačnej doby nakaziť iných ľudí vírusom HIV. Aj keď osoba s HIV nemá žiadne príznaky, vírus počas inkubačnej doby vytvára svoje kópie.