V chémii molekulový orbitál (alebo MO) vysvetľuje, čo sa stane s elektrónmi, keď sa atómy spoja do molekuly. MO je matematická funkcia, ktorá opisuje vlnové správanie elektrónu v molekule. Chemici používajú takéto funkcie na predpovedanie alebo vysvetlenie chemických a fyzikálnych vlastností. Funkcie môžu napríklad povedať pravdepodobnosť nájdenia elektrónu v akejkoľvek konkrétnej oblasti.

Chemici zvyčajne vytvárajú matematické modely molekulových orbitálov kombináciou atómových orbitálov. Môžu sa použiť aj hybridné orbitály z každého atómu molekuly alebo iné molekulové orbitály zo skupín atómov. Na týchto funkciách môžu pracovať počítače. Molekulové orbity umožňujú chemikom aplikovať kvantovú mechaniku na štúdium molekúl. MO odpovedajú na otázky o tom, ako atómy v molekulách držia pohromade. Rôzne zaoblené tvary v orbitálnom diagrame naznačujú, kde by sa v atóme s najväčšou pravdepodobnosťou nachádzali elektróny.